Protein–RNA interactions for Protein: Q14CM0

FRMPD4, FERM and PDZ domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,322 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMPD4Q14CM0 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
FRMPD4Q14CM0 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FRMPD4Q14CM0 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FRMPD4Q14CM0 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FRMPD4Q14CM0 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FRMPD4Q14CM0 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FRMPD4Q14CM0 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FRMPD4Q14CM0 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FRMPD4Q14CM0 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FRMPD4Q14CM0 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FRMPD4Q14CM0 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FRMPD4Q14CM0 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FRMPD4Q14CM0 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FRMPD4Q14CM0 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
FRMPD4Q14CM0 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FRMPD4Q14CM0 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FRMPD4Q14CM0 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FRMPD4Q14CM0 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FRMPD4Q14CM0 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FRMPD4Q14CM0 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FRMPD4Q14CM0 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
FRMPD4Q14CM0 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FRMPD4Q14CM0 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FRMPD4Q14CM0 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FRMPD4Q14CM0 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FRMPD4Q14CM0 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FRMPD4Q14CM0 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FRMPD4Q14CM0 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FRMPD4Q14CM0 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FRMPD4Q14CM0 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FRMPD4Q14CM0 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FRMPD4Q14CM0 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FRMPD4Q14CM0 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FRMPD4Q14CM0 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FRMPD4Q14CM0 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FRMPD4Q14CM0 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FRMPD4Q14CM0 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FRMPD4Q14CM0 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FRMPD4Q14CM0 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FRMPD4Q14CM0 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FRMPD4Q14CM0 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FRMPD4Q14CM0 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FRMPD4Q14CM0 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FRMPD4Q14CM0 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FRMPD4Q14CM0 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
FRMPD4Q14CM0 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
FRMPD4Q14CM0 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
FRMPD4Q14CM0 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FRMPD4Q14CM0 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
FRMPD4Q14CM0 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
FRMPD4Q14CM0 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FRMPD4Q14CM0 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
FRMPD4Q14CM0 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FRMPD4Q14CM0 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FRMPD4Q14CM0 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FRMPD4Q14CM0 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FRMPD4Q14CM0 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FRMPD4Q14CM0 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FRMPD4Q14CM0 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FRMPD4Q14CM0 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FRMPD4Q14CM0 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FRMPD4Q14CM0 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FRMPD4Q14CM0 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FRMPD4Q14CM0 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FRMPD4Q14CM0 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FRMPD4Q14CM0 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FRMPD4Q14CM0 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FRMPD4Q14CM0 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FRMPD4Q14CM0 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FRMPD4Q14CM0 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FRMPD4Q14CM0 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FRMPD4Q14CM0 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FRMPD4Q14CM0 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
FRMPD4Q14CM0 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FRMPD4Q14CM0 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FRMPD4Q14CM0 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FRMPD4Q14CM0 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FRMPD4Q14CM0 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
FRMPD4Q14CM0 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FRMPD4Q14CM0 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
FRMPD4Q14CM0 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FRMPD4Q14CM0 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
FRMPD4Q14CM0 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
FRMPD4Q14CM0 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
FRMPD4Q14CM0 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
FRMPD4Q14CM0 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
FRMPD4Q14CM0 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FRMPD4Q14CM0 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
FRMPD4Q14CM0 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
FRMPD4Q14CM0 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
FRMPD4Q14CM0 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
FRMPD4Q14CM0 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FRMPD4Q14CM0 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
FRMPD4Q14CM0 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FRMPD4Q14CM0 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
FRMPD4Q14CM0 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FRMPD4Q14CM0 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FRMPD4Q14CM0 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
FRMPD4Q14CM0 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FRMPD4Q14CM0 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms