Protein–RNA interactions for Protein: Q14574

DSC3, Desmocollin-3, humanhuman

Predictions only

Length 896 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC3Q14574 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
DSC3Q14574 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
DSC3Q14574 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
DSC3Q14574 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
DSC3Q14574 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
DSC3Q14574 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
DSC3Q14574 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
DSC3Q14574 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
DSC3Q14574 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
DSC3Q14574 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
DSC3Q14574 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
DSC3Q14574 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
DSC3Q14574 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
DSC3Q14574 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
DSC3Q14574 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
DSC3Q14574 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
DSC3Q14574 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
DSC3Q14574 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
DSC3Q14574 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
DSC3Q14574 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
DSC3Q14574 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
DSC3Q14574 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
DSC3Q14574 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
DSC3Q14574 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
DSC3Q14574 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
DSC3Q14574 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
DSC3Q14574 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
DSC3Q14574 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
DSC3Q14574 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
DSC3Q14574 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
DSC3Q14574 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
DSC3Q14574 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
DSC3Q14574 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
DSC3Q14574 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
DSC3Q14574 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
DSC3Q14574 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
DSC3Q14574 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
DSC3Q14574 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
DSC3Q14574 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
DSC3Q14574 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
DSC3Q14574 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
DSC3Q14574 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
DSC3Q14574 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
DSC3Q14574 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
DSC3Q14574 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
DSC3Q14574 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
DSC3Q14574 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
DSC3Q14574 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
DSC3Q14574 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
DSC3Q14574 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
DSC3Q14574 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
DSC3Q14574 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
DSC3Q14574 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
DSC3Q14574 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
DSC3Q14574 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
DSC3Q14574 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
DSC3Q14574 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
DSC3Q14574 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
DSC3Q14574 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
DSC3Q14574 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
DSC3Q14574 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
DSC3Q14574 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
DSC3Q14574 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
DSC3Q14574 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
DSC3Q14574 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
DSC3Q14574 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
DSC3Q14574 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
DSC3Q14574 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
DSC3Q14574 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
DSC3Q14574 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
DSC3Q14574 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
DSC3Q14574 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
DSC3Q14574 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
DSC3Q14574 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
DSC3Q14574 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
DSC3Q14574 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
DSC3Q14574 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
DSC3Q14574 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
DSC3Q14574 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
DSC3Q14574 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
DSC3Q14574 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
DSC3Q14574 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
DSC3Q14574 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
DSC3Q14574 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
DSC3Q14574 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
DSC3Q14574 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
DSC3Q14574 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
DSC3Q14574 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
DSC3Q14574 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
DSC3Q14574 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
DSC3Q14574 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
DSC3Q14574 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
DSC3Q14574 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
DSC3Q14574 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
DSC3Q14574 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
DSC3Q14574 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
DSC3Q14574 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
DSC3Q14574 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
DSC3Q14574 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
DSC3Q14574 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms