Protein–RNA interactions for Protein: Q13938

CAPS, Calcyphosin, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPSQ13938 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CAPSQ13938 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CAPSQ13938 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CAPSQ13938 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CAPSQ13938 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CAPSQ13938 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CAPSQ13938 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CAPSQ13938 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CAPSQ13938 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CAPSQ13938 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CAPSQ13938 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CAPSQ13938 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CAPSQ13938 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CAPSQ13938 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CAPSQ13938 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CAPSQ13938 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CAPSQ13938 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CAPSQ13938 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CAPSQ13938 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CAPSQ13938 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CAPSQ13938 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CAPSQ13938 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CAPSQ13938 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CAPSQ13938 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CAPSQ13938 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CAPSQ13938 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CAPSQ13938 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CAPSQ13938 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CAPSQ13938 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CAPSQ13938 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CAPSQ13938 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CAPSQ13938 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CAPSQ13938 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CAPSQ13938 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CAPSQ13938 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CAPSQ13938 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CAPSQ13938 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CAPSQ13938 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CAPSQ13938 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CAPSQ13938 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CAPSQ13938 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CAPSQ13938 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CAPSQ13938 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CAPSQ13938 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CAPSQ13938 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CAPSQ13938 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CAPSQ13938 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CAPSQ13938 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CAPSQ13938 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CAPSQ13938 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CAPSQ13938 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CAPSQ13938 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CAPSQ13938 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CAPSQ13938 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CAPSQ13938 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CAPSQ13938 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CAPSQ13938 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CAPSQ13938 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CAPSQ13938 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CAPSQ13938 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CAPSQ13938 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CAPSQ13938 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CAPSQ13938 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CAPSQ13938 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CAPSQ13938 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CAPSQ13938 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CAPSQ13938 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CAPSQ13938 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CAPSQ13938 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CAPSQ13938 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CAPSQ13938 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CAPSQ13938 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CAPSQ13938 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CAPSQ13938 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CAPSQ13938 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CAPSQ13938 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CAPSQ13938 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CAPSQ13938 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CAPSQ13938 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CAPSQ13938 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CAPSQ13938 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CAPSQ13938 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CAPSQ13938 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CAPSQ13938 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CAPSQ13938 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CAPSQ13938 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CAPSQ13938 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CAPSQ13938 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CAPSQ13938 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CAPSQ13938 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CAPSQ13938 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CAPSQ13938 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CAPSQ13938 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CAPSQ13938 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CAPSQ13938 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CAPSQ13938 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CAPSQ13938 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CAPSQ13938 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CAPSQ13938 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CAPSQ13938 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
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