Protein–RNA interactions for Protein: Q13670

PMS2P11, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P11Q13670 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
PMS2P11Q13670 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PMS2P11Q13670 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PMS2P11Q13670 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PMS2P11Q13670 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PMS2P11Q13670 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PMS2P11Q13670 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PMS2P11Q13670 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PMS2P11Q13670 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PMS2P11Q13670 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PMS2P11Q13670 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PMS2P11Q13670 COQ8A-203ENST00000366779 5523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PMS2P11Q13670 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PMS2P11Q13670 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PMS2P11Q13670 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PMS2P11Q13670 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PMS2P11Q13670 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PMS2P11Q13670 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PMS2P11Q13670 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PMS2P11Q13670 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PMS2P11Q13670 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PMS2P11Q13670 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PMS2P11Q13670 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PMS2P11Q13670 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
PMS2P11Q13670 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PMS2P11Q13670 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PMS2P11Q13670 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PMS2P11Q13670 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PMS2P11Q13670 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PMS2P11Q13670 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PMS2P11Q13670 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PMS2P11Q13670 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PMS2P11Q13670 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PMS2P11Q13670 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PMS2P11Q13670 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PMS2P11Q13670 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PMS2P11Q13670 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PMS2P11Q13670 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PMS2P11Q13670 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PMS2P11Q13670 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PMS2P11Q13670 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PMS2P11Q13670 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PMS2P11Q13670 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PMS2P11Q13670 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PMS2P11Q13670 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PMS2P11Q13670 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PMS2P11Q13670 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PMS2P11Q13670 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
PMS2P11Q13670 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PMS2P11Q13670 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PMS2P11Q13670 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
PMS2P11Q13670 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PMS2P11Q13670 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PMS2P11Q13670 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
PMS2P11Q13670 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
PMS2P11Q13670 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PMS2P11Q13670 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PMS2P11Q13670 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PMS2P11Q13670 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PMS2P11Q13670 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PMS2P11Q13670 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PMS2P11Q13670 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PMS2P11Q13670 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PMS2P11Q13670 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PMS2P11Q13670 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PMS2P11Q13670 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PMS2P11Q13670 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PMS2P11Q13670 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PMS2P11Q13670 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PMS2P11Q13670 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PMS2P11Q13670 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PMS2P11Q13670 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PMS2P11Q13670 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
PMS2P11Q13670 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
PMS2P11Q13670 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PMS2P11Q13670 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
PMS2P11Q13670 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.31
PMS2P11Q13670 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC13.15□□□□□ -0.31
PMS2P11Q13670 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
PMS2P11Q13670 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
PMS2P11Q13670 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PMS2P11Q13670 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PMS2P11Q13670 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PMS2P11Q13670 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PMS2P11Q13670 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PMS2P11Q13670 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PMS2P11Q13670 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PMS2P11Q13670 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PMS2P11Q13670 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
PMS2P11Q13670 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PMS2P11Q13670 PRKY-203ENST00000528056 7218 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PMS2P11Q13670 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PMS2P11Q13670 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PMS2P11Q13670 RREB1-202ENST00000349384 7440 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PMS2P11Q13670 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PMS2P11Q13670 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PMS2P11Q13670 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PMS2P11Q13670 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
PMS2P11Q13670 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PMS2P11Q13670 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms