Protein–RNA interactions for Protein: Q13263

TRIM28, Transcription intermediary factor 1-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 835 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM28Q13263 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRIM28Q13263 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRIM28Q13263 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRIM28Q13263 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRIM28Q13263 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRIM28Q13263 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRIM28Q13263 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRIM28Q13263 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRIM28Q13263 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
TRIM28Q13263 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRIM28Q13263 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRIM28Q13263 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRIM28Q13263 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRIM28Q13263 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRIM28Q13263 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRIM28Q13263 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
TRIM28Q13263 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRIM28Q13263 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRIM28Q13263 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRIM28Q13263 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRIM28Q13263 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRIM28Q13263 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRIM28Q13263 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRIM28Q13263 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRIM28Q13263 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRIM28Q13263 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRIM28Q13263 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRIM28Q13263 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRIM28Q13263 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRIM28Q13263 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRIM28Q13263 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRIM28Q13263 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRIM28Q13263 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRIM28Q13263 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRIM28Q13263 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRIM28Q13263 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRIM28Q13263 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRIM28Q13263 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
TRIM28Q13263 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRIM28Q13263 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRIM28Q13263 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRIM28Q13263 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRIM28Q13263 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRIM28Q13263 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
TRIM28Q13263 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRIM28Q13263 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRIM28Q13263 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRIM28Q13263 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRIM28Q13263 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
TRIM28Q13263 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRIM28Q13263 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRIM28Q13263 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRIM28Q13263 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRIM28Q13263 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRIM28Q13263 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRIM28Q13263 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRIM28Q13263 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRIM28Q13263 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRIM28Q13263 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRIM28Q13263 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRIM28Q13263 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRIM28Q13263 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRIM28Q13263 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRIM28Q13263 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRIM28Q13263 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRIM28Q13263 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRIM28Q13263 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRIM28Q13263 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRIM28Q13263 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRIM28Q13263 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRIM28Q13263 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRIM28Q13263 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRIM28Q13263 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRIM28Q13263 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRIM28Q13263 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRIM28Q13263 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRIM28Q13263 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRIM28Q13263 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRIM28Q13263 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRIM28Q13263 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRIM28Q13263 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
TRIM28Q13263 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRIM28Q13263 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRIM28Q13263 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRIM28Q13263 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRIM28Q13263 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRIM28Q13263 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRIM28Q13263 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRIM28Q13263 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
TRIM28Q13263 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
TRIM28Q13263 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
TRIM28Q13263 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
TRIM28Q13263 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
TRIM28Q13263 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
TRIM28Q13263 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
TRIM28Q13263 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRIM28Q13263 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRIM28Q13263 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRIM28Q13263 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
TRIM28Q13263 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
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