Protein–RNA interactions for Protein: Q13098

GPS1, COP9 signalosome complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPS1Q13098 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GPS1Q13098 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GPS1Q13098 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GPS1Q13098 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GPS1Q13098 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GPS1Q13098 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GPS1Q13098 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GPS1Q13098 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
GPS1Q13098 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GPS1Q13098 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GPS1Q13098 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
GPS1Q13098 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
GPS1Q13098 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GPS1Q13098 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GPS1Q13098 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GPS1Q13098 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GPS1Q13098 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GPS1Q13098 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GPS1Q13098 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GPS1Q13098 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GPS1Q13098 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GPS1Q13098 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GPS1Q13098 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GPS1Q13098 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GPS1Q13098 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GPS1Q13098 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GPS1Q13098 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GPS1Q13098 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GPS1Q13098 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GPS1Q13098 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GPS1Q13098 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GPS1Q13098 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GPS1Q13098 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GPS1Q13098 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GPS1Q13098 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
GPS1Q13098 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
GPS1Q13098 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GPS1Q13098 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GPS1Q13098 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GPS1Q13098 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GPS1Q13098 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GPS1Q13098 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GPS1Q13098 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GPS1Q13098 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
GPS1Q13098 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
GPS1Q13098 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GPS1Q13098 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GPS1Q13098 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GPS1Q13098 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GPS1Q13098 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GPS1Q13098 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GPS1Q13098 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GPS1Q13098 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GPS1Q13098 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GPS1Q13098 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GPS1Q13098 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GPS1Q13098 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GPS1Q13098 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GPS1Q13098 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GPS1Q13098 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GPS1Q13098 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GPS1Q13098 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GPS1Q13098 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
GPS1Q13098 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GPS1Q13098 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GPS1Q13098 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GPS1Q13098 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GPS1Q13098 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GPS1Q13098 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GPS1Q13098 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GPS1Q13098 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GPS1Q13098 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GPS1Q13098 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GPS1Q13098 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GPS1Q13098 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GPS1Q13098 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GPS1Q13098 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
GPS1Q13098 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GPS1Q13098 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GPS1Q13098 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GPS1Q13098 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
GPS1Q13098 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GPS1Q13098 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GPS1Q13098 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GPS1Q13098 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GPS1Q13098 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GPS1Q13098 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GPS1Q13098 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GPS1Q13098 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GPS1Q13098 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GPS1Q13098 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GPS1Q13098 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GPS1Q13098 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
GPS1Q13098 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GPS1Q13098 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GPS1Q13098 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GPS1Q13098 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GPS1Q13098 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GPS1Q13098 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GPS1Q13098 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms