Protein–RNA interactions for Protein: Q12857

NFIA, Nuclear factor 1 A-type, humanhuman

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Length 509 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIAQ12857 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
NFIAQ12857 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NFIAQ12857 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NFIAQ12857 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
NFIAQ12857 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NFIAQ12857 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NFIAQ12857 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NFIAQ12857 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NFIAQ12857 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
NFIAQ12857 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NFIAQ12857 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NFIAQ12857 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NFIAQ12857 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NFIAQ12857 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NFIAQ12857 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
NFIAQ12857 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NFIAQ12857 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NFIAQ12857 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NFIAQ12857 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NFIAQ12857 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NFIAQ12857 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NFIAQ12857 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NFIAQ12857 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NFIAQ12857 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NFIAQ12857 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NFIAQ12857 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NFIAQ12857 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NFIAQ12857 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NFIAQ12857 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NFIAQ12857 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NFIAQ12857 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NFIAQ12857 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NFIAQ12857 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NFIAQ12857 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NFIAQ12857 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NFIAQ12857 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NFIAQ12857 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
NFIAQ12857 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NFIAQ12857 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
NFIAQ12857 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
NFIAQ12857 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
NFIAQ12857 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NFIAQ12857 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
NFIAQ12857 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NFIAQ12857 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NFIAQ12857 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NFIAQ12857 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NFIAQ12857 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NFIAQ12857 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NFIAQ12857 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
NFIAQ12857 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NFIAQ12857 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NFIAQ12857 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NFIAQ12857 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NFIAQ12857 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
NFIAQ12857 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
NFIAQ12857 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
NFIAQ12857 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
NFIAQ12857 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
NFIAQ12857 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
NFIAQ12857 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
NFIAQ12857 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
NFIAQ12857 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
NFIAQ12857 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
NFIAQ12857 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NFIAQ12857 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NFIAQ12857 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
NFIAQ12857 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NFIAQ12857 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NFIAQ12857 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
NFIAQ12857 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NFIAQ12857 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NFIAQ12857 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NFIAQ12857 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NFIAQ12857 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NFIAQ12857 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NFIAQ12857 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NFIAQ12857 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NFIAQ12857 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NFIAQ12857 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
NFIAQ12857 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NFIAQ12857 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NFIAQ12857 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
NFIAQ12857 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NFIAQ12857 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NFIAQ12857 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NFIAQ12857 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NFIAQ12857 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NFIAQ12857 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NFIAQ12857 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
NFIAQ12857 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NFIAQ12857 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NFIAQ12857 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NFIAQ12857 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
NFIAQ12857 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NFIAQ12857 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NFIAQ12857 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NFIAQ12857 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NFIAQ12857 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NFIAQ12857 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
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