Protein–RNA interactions for Protein: Q12778

FOXO1, Forkhead box protein O1, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO1Q12778 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
FOXO1Q12778 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
FOXO1Q12778 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC14.79□□□□□ -0.04
FOXO1Q12778 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
FOXO1Q12778 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
FOXO1Q12778 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
FOXO1Q12778 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
FOXO1Q12778 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
FOXO1Q12778 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
FOXO1Q12778 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
FOXO1Q12778 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
FOXO1Q12778 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC14.79□□□□□ -0.04
FOXO1Q12778 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
FOXO1Q12778 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
FOXO1Q12778 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
FOXO1Q12778 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
FOXO1Q12778 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
FOXO1Q12778 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
FOXO1Q12778 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
FOXO1Q12778 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
FOXO1Q12778 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
FOXO1Q12778 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
FOXO1Q12778 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
FOXO1Q12778 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
FOXO1Q12778 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
FOXO1Q12778 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
FOXO1Q12778 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
FOXO1Q12778 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
FOXO1Q12778 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
FOXO1Q12778 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
FOXO1Q12778 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
FOXO1Q12778 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
FOXO1Q12778 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
FOXO1Q12778 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
FOXO1Q12778 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
FOXO1Q12778 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
FOXO1Q12778 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
FOXO1Q12778 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
FOXO1Q12778 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
FOXO1Q12778 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
FOXO1Q12778 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
FOXO1Q12778 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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FOXO1Q12778 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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FOXO1Q12778 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
FOXO1Q12778 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
FOXO1Q12778 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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FOXO1Q12778 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
FOXO1Q12778 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC14.78□□□□□ -0.04
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FOXO1Q12778 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
FOXO1Q12778 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
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FOXO1Q12778 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
FOXO1Q12778 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
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FOXO1Q12778 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
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FOXO1Q12778 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
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FOXO1Q12778 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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FOXO1Q12778 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
FOXO1Q12778 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
FOXO1Q12778 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
FOXO1Q12778 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
FOXO1Q12778 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
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