Protein–RNA interactions for Protein: Q12772

SREBF2, Sterol regulatory element-binding protein 2, humanhuman

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Length 1,141 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SREBF2Q12772 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SREBF2Q12772 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SREBF2Q12772 AC074194.1-201ENST00000505025 622 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SREBF2Q12772 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SREBF2Q12772 AC100858.3-202ENST00000533496 553 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SREBF2Q12772 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SREBF2Q12772 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SREBF2Q12772 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SREBF2Q12772 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SREBF2Q12772 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SREBF2Q12772 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SREBF2Q12772 ZNFX1-AS1_1.1-201ENST00000615787 198 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SREBF2Q12772 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SREBF2Q12772 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SREBF2Q12772 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SREBF2Q12772 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SREBF2Q12772 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SREBF2Q12772 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SREBF2Q12772 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SREBF2Q12772 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SREBF2Q12772 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SREBF2Q12772 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SREBF2Q12772 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SREBF2Q12772 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SREBF2Q12772 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SREBF2Q12772 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SREBF2Q12772 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SREBF2Q12772 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SREBF2Q12772 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SREBF2Q12772 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SREBF2Q12772 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SREBF2Q12772 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SREBF2Q12772 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SREBF2Q12772 ACTR2-205ENST00000542850 1429 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SREBF2Q12772 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SREBF2Q12772 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SREBF2Q12772 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SREBF2Q12772 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SREBF2Q12772 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SREBF2Q12772 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SREBF2Q12772 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SREBF2Q12772 AC106786.1-201ENST00000442777 792 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SREBF2Q12772 CENPBD1P1-203ENST00000479047 569 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SREBF2Q12772 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SREBF2Q12772 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SREBF2Q12772 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SREBF2Q12772 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SREBF2Q12772 TP53AIP1-205ENST00000531399 806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SREBF2Q12772 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SREBF2Q12772 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SREBF2Q12772 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SREBF2Q12772 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SREBF2Q12772 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SREBF2Q12772 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SREBF2Q12772 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SREBF2Q12772 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SREBF2Q12772 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SREBF2Q12772 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SREBF2Q12772 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SREBF2Q12772 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SREBF2Q12772 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SREBF2Q12772 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SREBF2Q12772 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SREBF2Q12772 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SREBF2Q12772 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SREBF2Q12772 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SREBF2Q12772 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SREBF2Q12772 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SREBF2Q12772 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SREBF2Q12772 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SREBF2Q12772 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SREBF2Q12772 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SREBF2Q12772 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SREBF2Q12772 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SREBF2Q12772 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SREBF2Q12772 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SREBF2Q12772 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SREBF2Q12772 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SREBF2Q12772 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SREBF2Q12772 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SREBF2Q12772 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SREBF2Q12772 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SREBF2Q12772 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SREBF2Q12772 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SREBF2Q12772 LINC01806-201ENST00000436506 765 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SREBF2Q12772 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SREBF2Q12772 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SREBF2Q12772 AC105129.2-201ENST00000559536 390 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SREBF2Q12772 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SREBF2Q12772 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SREBF2Q12772 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SREBF2Q12772 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SREBF2Q12772 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SREBF2Q12772 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SREBF2Q12772 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SREBF2Q12772 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SREBF2Q12772 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SREBF2Q12772 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SREBF2Q12772 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SREBF2Q12772 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
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