Protein–RNA interactions for Protein: Q0VFZ6

CCDC173, Coiled-coil domain-containing protein 173, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC173Q0VFZ6 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC173Q0VFZ6 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC173Q0VFZ6 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC173Q0VFZ6 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC173Q0VFZ6 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC173Q0VFZ6 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC173Q0VFZ6 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC173Q0VFZ6 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC173Q0VFZ6 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC173Q0VFZ6 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC173Q0VFZ6 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC173Q0VFZ6 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC173Q0VFZ6 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC173Q0VFZ6 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC173Q0VFZ6 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC173Q0VFZ6 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC173Q0VFZ6 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC173Q0VFZ6 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC173Q0VFZ6 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC173Q0VFZ6 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC173Q0VFZ6 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC173Q0VFZ6 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC173Q0VFZ6 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC173Q0VFZ6 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC173Q0VFZ6 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC173Q0VFZ6 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC173Q0VFZ6 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC173Q0VFZ6 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC173Q0VFZ6 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC173Q0VFZ6 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC173Q0VFZ6 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC173Q0VFZ6 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC173Q0VFZ6 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC173Q0VFZ6 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC173Q0VFZ6 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC173Q0VFZ6 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC173Q0VFZ6 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC173Q0VFZ6 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC173Q0VFZ6 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC173Q0VFZ6 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC173Q0VFZ6 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC173Q0VFZ6 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC173Q0VFZ6 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC173Q0VFZ6 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC173Q0VFZ6 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC173Q0VFZ6 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC173Q0VFZ6 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC173Q0VFZ6 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC173Q0VFZ6 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC173Q0VFZ6 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC173Q0VFZ6 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC173Q0VFZ6 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC173Q0VFZ6 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC173Q0VFZ6 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC173Q0VFZ6 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC173Q0VFZ6 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC173Q0VFZ6 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC173Q0VFZ6 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC173Q0VFZ6 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC173Q0VFZ6 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC173Q0VFZ6 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC173Q0VFZ6 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC173Q0VFZ6 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC173Q0VFZ6 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC173Q0VFZ6 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC173Q0VFZ6 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC173Q0VFZ6 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC173Q0VFZ6 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC173Q0VFZ6 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC173Q0VFZ6 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC173Q0VFZ6 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC173Q0VFZ6 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC173Q0VFZ6 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC173Q0VFZ6 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC173Q0VFZ6 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC173Q0VFZ6 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC173Q0VFZ6 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC173Q0VFZ6 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC173Q0VFZ6 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC173Q0VFZ6 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC173Q0VFZ6 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC173Q0VFZ6 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC173Q0VFZ6 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC173Q0VFZ6 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC173Q0VFZ6 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC173Q0VFZ6 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC173Q0VFZ6 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC173Q0VFZ6 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC173Q0VFZ6 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC173Q0VFZ6 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC173Q0VFZ6 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC173Q0VFZ6 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC173Q0VFZ6 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC173Q0VFZ6 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC173Q0VFZ6 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC173Q0VFZ6 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC173Q0VFZ6 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC173Q0VFZ6 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC173Q0VFZ6 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC173Q0VFZ6 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.1 ms