Protein–RNA interactions for Protein: Q09472

EP300, Histone acetyltransferase p300, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EP300Q09472 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
EP300Q09472 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
EP300Q09472 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
EP300Q09472 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
EP300Q09472 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
EP300Q09472 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
EP300Q09472 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.66■□□□□ 0.1
EP300Q09472 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
EP300Q09472 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
EP300Q09472 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
EP300Q09472 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
EP300Q09472 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
EP300Q09472 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC15.66■□□□□ 0.1
EP300Q09472 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
EP300Q09472 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
EP300Q09472 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
EP300Q09472 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
EP300Q09472 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
EP300Q09472 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
EP300Q09472 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
EP300Q09472 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
EP300Q09472 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
EP300Q09472 IFI35-203ENST00000415816 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
EP300Q09472 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
EP300Q09472 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
EP300Q09472 SLIRP-210ENST00000557431 725 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
EP300Q09472 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
EP300Q09472 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC15.65■□□□□ 0.1
EP300Q09472 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
EP300Q09472 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
EP300Q09472 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
EP300Q09472 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
EP300Q09472 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
EP300Q09472 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
EP300Q09472 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
EP300Q09472 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
EP300Q09472 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
EP300Q09472 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
EP300Q09472 TCL1B-201ENST00000340722 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
EP300Q09472 AK1-202ENST00000373156 757 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
EP300Q09472 STX1A-202ENST00000395154 1022 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
EP300Q09472 CYP46A4P-201ENST00000414953 267 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
EP300Q09472 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
EP300Q09472 RN7SL574P-201ENST00000581512 297 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
EP300Q09472 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC15.65■□□□□ 0.1
EP300Q09472 NEAT1-203ENST00000601801 487 ntTSL 4 BASIC15.65■□□□□ 0.1
EP300Q09472 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
EP300Q09472 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
EP300Q09472 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
EP300Q09472 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
EP300Q09472 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
EP300Q09472 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.1
EP300Q09472 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
EP300Q09472 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
EP300Q09472 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
EP300Q09472 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
EP300Q09472 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
EP300Q09472 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
EP300Q09472 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
EP300Q09472 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
EP300Q09472 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
EP300Q09472 CFL1-214ENST00000534769 758 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
EP300Q09472 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
EP300Q09472 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
EP300Q09472 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
EP300Q09472 CU633904.3-201ENST00000624042 1029 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
EP300Q09472 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
EP300Q09472 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
EP300Q09472 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
EP300Q09472 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
EP300Q09472 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
EP300Q09472 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
EP300Q09472 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
EP300Q09472 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
EP300Q09472 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
EP300Q09472 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
EP300Q09472 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
EP300Q09472 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
EP300Q09472 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
EP300Q09472 AC131097.2-203ENST00000401641 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
EP300Q09472 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
EP300Q09472 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
EP300Q09472 FKBP11-212ENST00000552878 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
EP300Q09472 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
EP300Q09472 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
EP300Q09472 LINC01229-204ENST00000568751 720 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
EP300Q09472 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
EP300Q09472 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
EP300Q09472 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
EP300Q09472 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
EP300Q09472 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
EP300Q09472 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EP300Q09472 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EP300Q09472 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EP300Q09472 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EP300Q09472 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EP300Q09472 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EP300Q09472 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EP300Q09472 AC006480.2-201ENST00000609770 1337 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
EP300Q09472 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms