Protein–RNA interactions for Protein: Q06323

PSME1, Proteasome activator complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME1Q06323 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PSME1Q06323 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PSME1Q06323 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PSME1Q06323 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PSME1Q06323 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PSME1Q06323 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PSME1Q06323 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PSME1Q06323 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PSME1Q06323 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PSME1Q06323 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PSME1Q06323 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PSME1Q06323 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PSME1Q06323 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PSME1Q06323 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PSME1Q06323 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PSME1Q06323 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
PSME1Q06323 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
PSME1Q06323 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
PSME1Q06323 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PSME1Q06323 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PSME1Q06323 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PSME1Q06323 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PSME1Q06323 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PSME1Q06323 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PSME1Q06323 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PSME1Q06323 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PSME1Q06323 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PSME1Q06323 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PSME1Q06323 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PSME1Q06323 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PSME1Q06323 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PSME1Q06323 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PSME1Q06323 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PSME1Q06323 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PSME1Q06323 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PSME1Q06323 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PSME1Q06323 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PSME1Q06323 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PSME1Q06323 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PSME1Q06323 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PSME1Q06323 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
PSME1Q06323 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PSME1Q06323 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PSME1Q06323 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PSME1Q06323 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PSME1Q06323 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PSME1Q06323 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PSME1Q06323 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PSME1Q06323 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PSME1Q06323 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PSME1Q06323 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PSME1Q06323 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PSME1Q06323 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PSME1Q06323 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PSME1Q06323 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PSME1Q06323 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PSME1Q06323 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PSME1Q06323 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
PSME1Q06323 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PSME1Q06323 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PSME1Q06323 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PSME1Q06323 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PSME1Q06323 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PSME1Q06323 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PSME1Q06323 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PSME1Q06323 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PSME1Q06323 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PSME1Q06323 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PSME1Q06323 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PSME1Q06323 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
PSME1Q06323 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PSME1Q06323 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PSME1Q06323 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PSME1Q06323 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PSME1Q06323 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PSME1Q06323 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PSME1Q06323 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PSME1Q06323 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PSME1Q06323 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PSME1Q06323 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PSME1Q06323 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PSME1Q06323 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PSME1Q06323 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PSME1Q06323 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PSME1Q06323 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PSME1Q06323 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PSME1Q06323 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PSME1Q06323 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PSME1Q06323 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PSME1Q06323 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
PSME1Q06323 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PSME1Q06323 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PSME1Q06323 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PSME1Q06323 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PSME1Q06323 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PSME1Q06323 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PSME1Q06323 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
PSME1Q06323 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PSME1Q06323 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
PSME1Q06323 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms