Protein–RNA interactions for Protein: Q04446

GBE1, 1,4-alpha-glucan-branching enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBE1Q04446 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GBE1Q04446 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GBE1Q04446 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GBE1Q04446 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GBE1Q04446 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GBE1Q04446 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GBE1Q04446 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
GBE1Q04446 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GBE1Q04446 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GBE1Q04446 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
GBE1Q04446 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GBE1Q04446 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GBE1Q04446 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GBE1Q04446 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GBE1Q04446 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
GBE1Q04446 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
GBE1Q04446 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
GBE1Q04446 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
GBE1Q04446 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
GBE1Q04446 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
GBE1Q04446 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.27
GBE1Q04446 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
GBE1Q04446 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
GBE1Q04446 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
GBE1Q04446 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
GBE1Q04446 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
GBE1Q04446 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
GBE1Q04446 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GBE1Q04446 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GBE1Q04446 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GBE1Q04446 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GBE1Q04446 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GBE1Q04446 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GBE1Q04446 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GBE1Q04446 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GBE1Q04446 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GBE1Q04446 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GBE1Q04446 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GBE1Q04446 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GBE1Q04446 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GBE1Q04446 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GBE1Q04446 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GBE1Q04446 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GBE1Q04446 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GBE1Q04446 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GBE1Q04446 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GBE1Q04446 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GBE1Q04446 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GBE1Q04446 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GBE1Q04446 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
GBE1Q04446 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
GBE1Q04446 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GBE1Q04446 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GBE1Q04446 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GBE1Q04446 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GBE1Q04446 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GBE1Q04446 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GBE1Q04446 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GBE1Q04446 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GBE1Q04446 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GBE1Q04446 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GBE1Q04446 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GBE1Q04446 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GBE1Q04446 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GBE1Q04446 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GBE1Q04446 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
GBE1Q04446 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GBE1Q04446 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GBE1Q04446 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GBE1Q04446 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GBE1Q04446 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GBE1Q04446 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GBE1Q04446 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GBE1Q04446 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GBE1Q04446 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GBE1Q04446 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GBE1Q04446 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GBE1Q04446 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GBE1Q04446 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GBE1Q04446 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GBE1Q04446 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GBE1Q04446 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GBE1Q04446 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GBE1Q04446 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GBE1Q04446 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GBE1Q04446 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GBE1Q04446 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GBE1Q04446 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GBE1Q04446 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GBE1Q04446 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GBE1Q04446 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GBE1Q04446 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GBE1Q04446 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GBE1Q04446 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GBE1Q04446 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
GBE1Q04446 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
GBE1Q04446 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GBE1Q04446 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GBE1Q04446 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GBE1Q04446 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms