Protein–RNA interactions for Protein: Q03188

CENPC, Centromere protein C, humanhuman

Predictions only

Length 943 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPCQ03188 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CENPCQ03188 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CENPCQ03188 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CENPCQ03188 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CENPCQ03188 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CENPCQ03188 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CENPCQ03188 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CENPCQ03188 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CENPCQ03188 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CENPCQ03188 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CENPCQ03188 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CENPCQ03188 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CENPCQ03188 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CENPCQ03188 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CENPCQ03188 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CENPCQ03188 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CENPCQ03188 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CENPCQ03188 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CENPCQ03188 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CENPCQ03188 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CENPCQ03188 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CENPCQ03188 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CENPCQ03188 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CENPCQ03188 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CENPCQ03188 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CENPCQ03188 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CENPCQ03188 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CENPCQ03188 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CENPCQ03188 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CENPCQ03188 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CENPCQ03188 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CENPCQ03188 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CENPCQ03188 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CENPCQ03188 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CENPCQ03188 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CENPCQ03188 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CENPCQ03188 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CENPCQ03188 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CENPCQ03188 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CENPCQ03188 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CENPCQ03188 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CENPCQ03188 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CENPCQ03188 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CENPCQ03188 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CENPCQ03188 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CENPCQ03188 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CENPCQ03188 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CENPCQ03188 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CENPCQ03188 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CENPCQ03188 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CENPCQ03188 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CENPCQ03188 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CENPCQ03188 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CENPCQ03188 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CENPCQ03188 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CENPCQ03188 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CENPCQ03188 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CENPCQ03188 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CENPCQ03188 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CENPCQ03188 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CENPCQ03188 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CENPCQ03188 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CENPCQ03188 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CENPCQ03188 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CENPCQ03188 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CENPCQ03188 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CENPCQ03188 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CENPCQ03188 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CENPCQ03188 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CENPCQ03188 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CENPCQ03188 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CENPCQ03188 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CENPCQ03188 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CENPCQ03188 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CENPCQ03188 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CENPCQ03188 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CENPCQ03188 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CENPCQ03188 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CENPCQ03188 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CENPCQ03188 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CENPCQ03188 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CENPCQ03188 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CENPCQ03188 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CENPCQ03188 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CENPCQ03188 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CENPCQ03188 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CENPCQ03188 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CENPCQ03188 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CENPCQ03188 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CENPCQ03188 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CENPCQ03188 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CENPCQ03188 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CENPCQ03188 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CENPCQ03188 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CENPCQ03188 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CENPCQ03188 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CENPCQ03188 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CENPCQ03188 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CENPCQ03188 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CENPCQ03188 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.4 ms