Protein–RNA interactions for Protein: Q03060

CREM, cAMP-responsive element modulator, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREMQ03060 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CREMQ03060 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CREMQ03060 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CREMQ03060 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CREMQ03060 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CREMQ03060 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CREMQ03060 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CREMQ03060 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CREMQ03060 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CREMQ03060 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CREMQ03060 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CREMQ03060 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CREMQ03060 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CREMQ03060 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CREMQ03060 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CREMQ03060 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CREMQ03060 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CREMQ03060 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CREMQ03060 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CREMQ03060 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CREMQ03060 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CREMQ03060 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CREMQ03060 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CREMQ03060 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CREMQ03060 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CREMQ03060 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CREMQ03060 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CREMQ03060 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CREMQ03060 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CREMQ03060 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CREMQ03060 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CREMQ03060 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CREMQ03060 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CREMQ03060 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CREMQ03060 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CREMQ03060 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CREMQ03060 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CREMQ03060 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CREMQ03060 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CREMQ03060 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CREMQ03060 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CREMQ03060 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CREMQ03060 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CREMQ03060 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CREMQ03060 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CREMQ03060 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CREMQ03060 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CREMQ03060 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CREMQ03060 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CREMQ03060 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CREMQ03060 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CREMQ03060 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CREMQ03060 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CREMQ03060 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CREMQ03060 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CREMQ03060 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CREMQ03060 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CREMQ03060 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CREMQ03060 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CREMQ03060 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CREMQ03060 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CREMQ03060 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CREMQ03060 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CREMQ03060 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CREMQ03060 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CREMQ03060 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CREMQ03060 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CREMQ03060 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CREMQ03060 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CREMQ03060 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CREMQ03060 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CREMQ03060 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CREMQ03060 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CREMQ03060 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CREMQ03060 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CREMQ03060 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CREMQ03060 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CREMQ03060 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CREMQ03060 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CREMQ03060 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CREMQ03060 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CREMQ03060 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CREMQ03060 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CREMQ03060 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CREMQ03060 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CREMQ03060 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CREMQ03060 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CREMQ03060 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CREMQ03060 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CREMQ03060 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CREMQ03060 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CREMQ03060 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CREMQ03060 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CREMQ03060 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CREMQ03060 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CREMQ03060 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CREMQ03060 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CREMQ03060 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CREMQ03060 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CREMQ03060 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms