Protein–RNA interactions for Protein: Q02224

CENPE, Centromere-associated protein E, humanhuman

Predictions only

Length 2,701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPEQ02224 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CENPEQ02224 TLDC2-203ENST00000602922 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CENPEQ02224 NR2F2-AS1-215ENST00000620029 1223 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CENPEQ02224 AC091812.3-201ENST00000621362 345 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
CENPEQ02224 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
CENPEQ02224 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CENPEQ02224 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CENPEQ02224 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
CENPEQ02224 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CENPEQ02224 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CENPEQ02224 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CENPEQ02224 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CENPEQ02224 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CENPEQ02224 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CENPEQ02224 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CENPEQ02224 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CENPEQ02224 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CENPEQ02224 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CENPEQ02224 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CENPEQ02224 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CENPEQ02224 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CENPEQ02224 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CENPEQ02224 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CENPEQ02224 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CENPEQ02224 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CENPEQ02224 ATP5H-201ENST00000301587 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CENPEQ02224 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CENPEQ02224 LYPLA2-202ENST00000374502 1072 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CENPEQ02224 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CENPEQ02224 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CENPEQ02224 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CENPEQ02224 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
CENPEQ02224 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
CENPEQ02224 MIR4750-201ENST00000584564 56 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
CENPEQ02224 SRD5A3-AS1-211ENST00000599135 737 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CENPEQ02224 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
CENPEQ02224 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CENPEQ02224 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CENPEQ02224 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CENPEQ02224 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CENPEQ02224 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CENPEQ02224 SHOX-202ENST00000381575 1351 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CENPEQ02224 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CENPEQ02224 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CENPEQ02224 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CENPEQ02224 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CENPEQ02224 NUDT1-201ENST00000339737 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CENPEQ02224 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CENPEQ02224 IGLJ3-201ENST00000390324 176 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CENPEQ02224 IDI2-AS1-201ENST00000420381 672 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CENPEQ02224 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CENPEQ02224 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
CENPEQ02224 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CENPEQ02224 MRPL48-210ENST00000542303 661 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CENPEQ02224 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CENPEQ02224 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CENPEQ02224 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CENPEQ02224 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CENPEQ02224 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CENPEQ02224 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CENPEQ02224 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CENPEQ02224 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CENPEQ02224 UPK3BL1-201ENST00000340457 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CENPEQ02224 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CENPEQ02224 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CENPEQ02224 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CENPEQ02224 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CENPEQ02224 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
CENPEQ02224 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CENPEQ02224 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CENPEQ02224 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CENPEQ02224 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CENPEQ02224 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CENPEQ02224 NR0B2-201ENST00000254227 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CENPEQ02224 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CENPEQ02224 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CENPEQ02224 FAM177A1-202ENST00000382406 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CENPEQ02224 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
CENPEQ02224 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CENPEQ02224 NUP210P1-202ENST00000504322 710 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
CENPEQ02224 TMBIM4-205ENST00000535812 766 ntTSL 4 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CENPEQ02224 TMBIM4-212ENST00000556010 610 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CENPEQ02224 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
CENPEQ02224 LINC01229-204ENST00000568751 720 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CENPEQ02224 HS3ST3A1-202ENST00000578576 750 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CENPEQ02224 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CENPEQ02224 AC148477.9-201ENST00000623974 539 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
CENPEQ02224 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CENPEQ02224 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
CENPEQ02224 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CENPEQ02224 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CENPEQ02224 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CENPEQ02224 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CENPEQ02224 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CENPEQ02224 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CENPEQ02224 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CENPEQ02224 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CENPEQ02224 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CENPEQ02224 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CENPEQ02224 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms