Protein–RNA interactions for Protein: Q01959

SLC6A3, Sodium-dependent dopamine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A3Q01959 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SLC6A3Q01959 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SLC6A3Q01959 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SLC6A3Q01959 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SLC6A3Q01959 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
SLC6A3Q01959 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SLC6A3Q01959 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SLC6A3Q01959 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SLC6A3Q01959 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SLC6A3Q01959 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SLC6A3Q01959 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SLC6A3Q01959 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
SLC6A3Q01959 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SLC6A3Q01959 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
SLC6A3Q01959 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SLC6A3Q01959 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SLC6A3Q01959 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SLC6A3Q01959 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SLC6A3Q01959 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SLC6A3Q01959 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SLC6A3Q01959 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SLC6A3Q01959 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SLC6A3Q01959 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SLC6A3Q01959 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SLC6A3Q01959 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SLC6A3Q01959 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SLC6A3Q01959 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SLC6A3Q01959 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SLC6A3Q01959 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SLC6A3Q01959 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SLC6A3Q01959 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SLC6A3Q01959 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SLC6A3Q01959 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SLC6A3Q01959 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SLC6A3Q01959 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SLC6A3Q01959 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SLC6A3Q01959 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SLC6A3Q01959 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SLC6A3Q01959 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SLC6A3Q01959 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SLC6A3Q01959 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SLC6A3Q01959 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
SLC6A3Q01959 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SLC6A3Q01959 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SLC6A3Q01959 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SLC6A3Q01959 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
SLC6A3Q01959 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SLC6A3Q01959 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SLC6A3Q01959 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SLC6A3Q01959 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SLC6A3Q01959 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SLC6A3Q01959 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SLC6A3Q01959 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SLC6A3Q01959 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SLC6A3Q01959 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SLC6A3Q01959 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SLC6A3Q01959 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SLC6A3Q01959 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SLC6A3Q01959 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SLC6A3Q01959 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SLC6A3Q01959 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SLC6A3Q01959 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SLC6A3Q01959 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SLC6A3Q01959 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SLC6A3Q01959 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SLC6A3Q01959 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SLC6A3Q01959 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SLC6A3Q01959 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SLC6A3Q01959 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SLC6A3Q01959 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SLC6A3Q01959 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SLC6A3Q01959 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SLC6A3Q01959 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SLC6A3Q01959 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SLC6A3Q01959 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SLC6A3Q01959 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SLC6A3Q01959 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SLC6A3Q01959 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SLC6A3Q01959 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SLC6A3Q01959 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
SLC6A3Q01959 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
SLC6A3Q01959 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SLC6A3Q01959 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
SLC6A3Q01959 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SLC6A3Q01959 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
SLC6A3Q01959 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
SLC6A3Q01959 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
SLC6A3Q01959 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SLC6A3Q01959 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
SLC6A3Q01959 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SLC6A3Q01959 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SLC6A3Q01959 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SLC6A3Q01959 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SLC6A3Q01959 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SLC6A3Q01959 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SLC6A3Q01959 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SLC6A3Q01959 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SLC6A3Q01959 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SLC6A3Q01959 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
SLC6A3Q01959 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms