Protein–RNA interactions for Protein: Q00978

IRF9, Interferon regulatory factor 9, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF9Q00978 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
IRF9Q00978 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
IRF9Q00978 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
IRF9Q00978 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
IRF9Q00978 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
IRF9Q00978 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
IRF9Q00978 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
IRF9Q00978 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
IRF9Q00978 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
IRF9Q00978 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
IRF9Q00978 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
IRF9Q00978 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
IRF9Q00978 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
IRF9Q00978 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
IRF9Q00978 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
IRF9Q00978 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
IRF9Q00978 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
IRF9Q00978 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
IRF9Q00978 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
IRF9Q00978 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
IRF9Q00978 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
IRF9Q00978 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
IRF9Q00978 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
IRF9Q00978 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
IRF9Q00978 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
IRF9Q00978 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
IRF9Q00978 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
IRF9Q00978 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
IRF9Q00978 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
IRF9Q00978 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
IRF9Q00978 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
IRF9Q00978 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
IRF9Q00978 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
IRF9Q00978 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
IRF9Q00978 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
IRF9Q00978 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
IRF9Q00978 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
IRF9Q00978 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
IRF9Q00978 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
IRF9Q00978 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
IRF9Q00978 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
IRF9Q00978 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
IRF9Q00978 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
IRF9Q00978 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
IRF9Q00978 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
IRF9Q00978 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
IRF9Q00978 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
IRF9Q00978 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
IRF9Q00978 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
IRF9Q00978 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
IRF9Q00978 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
IRF9Q00978 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
IRF9Q00978 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
IRF9Q00978 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
IRF9Q00978 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
IRF9Q00978 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
IRF9Q00978 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
IRF9Q00978 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
IRF9Q00978 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
IRF9Q00978 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
IRF9Q00978 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
IRF9Q00978 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
IRF9Q00978 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
IRF9Q00978 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
IRF9Q00978 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
IRF9Q00978 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
IRF9Q00978 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
IRF9Q00978 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
IRF9Q00978 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
IRF9Q00978 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
IRF9Q00978 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
IRF9Q00978 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
IRF9Q00978 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
IRF9Q00978 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
IRF9Q00978 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
IRF9Q00978 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
IRF9Q00978 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
IRF9Q00978 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
IRF9Q00978 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
IRF9Q00978 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
IRF9Q00978 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
IRF9Q00978 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
IRF9Q00978 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
IRF9Q00978 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
IRF9Q00978 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
IRF9Q00978 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
IRF9Q00978 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
IRF9Q00978 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
IRF9Q00978 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
IRF9Q00978 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
IRF9Q00978 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
IRF9Q00978 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
IRF9Q00978 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
IRF9Q00978 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
IRF9Q00978 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
IRF9Q00978 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
IRF9Q00978 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
IRF9Q00978 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
IRF9Q00978 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
IRF9Q00978 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms