Protein–RNA interactions for Protein: P59894

DCDC1, Doublecortin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCDC1P59894 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DCDC1P59894 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DCDC1P59894 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
DCDC1P59894 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
DCDC1P59894 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DCDC1P59894 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DCDC1P59894 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DCDC1P59894 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DCDC1P59894 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DCDC1P59894 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DCDC1P59894 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DCDC1P59894 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DCDC1P59894 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DCDC1P59894 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DCDC1P59894 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DCDC1P59894 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DCDC1P59894 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
DCDC1P59894 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
DCDC1P59894 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DCDC1P59894 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DCDC1P59894 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DCDC1P59894 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DCDC1P59894 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DCDC1P59894 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DCDC1P59894 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DCDC1P59894 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DCDC1P59894 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DCDC1P59894 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DCDC1P59894 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DCDC1P59894 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
DCDC1P59894 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DCDC1P59894 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DCDC1P59894 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DCDC1P59894 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DCDC1P59894 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DCDC1P59894 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DCDC1P59894 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DCDC1P59894 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DCDC1P59894 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DCDC1P59894 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DCDC1P59894 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DCDC1P59894 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DCDC1P59894 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DCDC1P59894 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DCDC1P59894 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DCDC1P59894 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DCDC1P59894 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DCDC1P59894 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DCDC1P59894 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DCDC1P59894 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DCDC1P59894 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DCDC1P59894 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DCDC1P59894 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DCDC1P59894 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DCDC1P59894 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DCDC1P59894 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DCDC1P59894 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DCDC1P59894 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DCDC1P59894 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DCDC1P59894 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DCDC1P59894 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DCDC1P59894 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DCDC1P59894 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DCDC1P59894 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DCDC1P59894 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DCDC1P59894 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DCDC1P59894 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DCDC1P59894 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DCDC1P59894 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DCDC1P59894 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DCDC1P59894 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DCDC1P59894 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DCDC1P59894 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DCDC1P59894 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DCDC1P59894 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DCDC1P59894 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DCDC1P59894 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DCDC1P59894 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
DCDC1P59894 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DCDC1P59894 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DCDC1P59894 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DCDC1P59894 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
DCDC1P59894 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DCDC1P59894 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
DCDC1P59894 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DCDC1P59894 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
DCDC1P59894 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DCDC1P59894 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DCDC1P59894 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DCDC1P59894 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DCDC1P59894 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
DCDC1P59894 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DCDC1P59894 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DCDC1P59894 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DCDC1P59894 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DCDC1P59894 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DCDC1P59894 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DCDC1P59894 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DCDC1P59894 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DCDC1P59894 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms