Protein–RNA interactions for Protein: P49759

CLK1, Dual specificity protein kinase CLK1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLK1P49759 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLK1P49759 ELK1-201ENST00000247161 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLK1P49759 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLK1P49759 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLK1P49759 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLK1P49759 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLK1P49759 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLK1P49759 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CLK1P49759 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLK1P49759 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLK1P49759 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLK1P49759 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLK1P49759 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLK1P49759 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CLK1P49759 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLK1P49759 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLK1P49759 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLK1P49759 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLK1P49759 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLK1P49759 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLK1P49759 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLK1P49759 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLK1P49759 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLK1P49759 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLK1P49759 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLK1P49759 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLK1P49759 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLK1P49759 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLK1P49759 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CLK1P49759 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLK1P49759 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLK1P49759 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLK1P49759 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLK1P49759 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLK1P49759 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLK1P49759 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLK1P49759 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLK1P49759 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLK1P49759 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLK1P49759 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLK1P49759 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLK1P49759 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLK1P49759 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLK1P49759 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLK1P49759 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLK1P49759 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLK1P49759 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLK1P49759 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLK1P49759 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLK1P49759 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLK1P49759 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLK1P49759 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLK1P49759 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLK1P49759 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLK1P49759 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLK1P49759 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLK1P49759 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLK1P49759 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLK1P49759 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLK1P49759 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLK1P49759 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLK1P49759 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLK1P49759 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLK1P49759 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLK1P49759 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLK1P49759 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLK1P49759 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLK1P49759 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLK1P49759 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLK1P49759 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CLK1P49759 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLK1P49759 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLK1P49759 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLK1P49759 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLK1P49759 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CLK1P49759 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLK1P49759 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLK1P49759 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLK1P49759 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLK1P49759 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLK1P49759 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLK1P49759 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLK1P49759 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLK1P49759 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLK1P49759 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLK1P49759 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLK1P49759 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLK1P49759 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CLK1P49759 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLK1P49759 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLK1P49759 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLK1P49759 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLK1P49759 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLK1P49759 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLK1P49759 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLK1P49759 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLK1P49759 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLK1P49759 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CLK1P49759 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLK1P49759 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 160.2 ms