Protein–RNA interactions for Protein: P45954

ACADSB, Short/branched chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSBP45954 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ACADSBP45954 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ACADSBP45954 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
ACADSBP45954 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ACADSBP45954 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ACADSBP45954 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ACADSBP45954 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ACADSBP45954 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ACADSBP45954 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ACADSBP45954 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ACADSBP45954 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ACADSBP45954 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ACADSBP45954 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ACADSBP45954 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ACADSBP45954 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ACADSBP45954 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ACADSBP45954 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ACADSBP45954 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ACADSBP45954 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ACADSBP45954 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ACADSBP45954 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ACADSBP45954 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ACADSBP45954 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ACADSBP45954 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ACADSBP45954 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ACADSBP45954 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ACADSBP45954 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ACADSBP45954 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ACADSBP45954 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ACADSBP45954 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ACADSBP45954 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ACADSBP45954 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ACADSBP45954 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ACADSBP45954 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ACADSBP45954 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ACADSBP45954 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ACADSBP45954 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ACADSBP45954 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
ACADSBP45954 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ACADSBP45954 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ACADSBP45954 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ACADSBP45954 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ACADSBP45954 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ACADSBP45954 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ACADSBP45954 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ACADSBP45954 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ACADSBP45954 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ACADSBP45954 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ACADSBP45954 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ACADSBP45954 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ACADSBP45954 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ACADSBP45954 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ACADSBP45954 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ACADSBP45954 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ACADSBP45954 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ACADSBP45954 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ACADSBP45954 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ACADSBP45954 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ACADSBP45954 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ACADSBP45954 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ACADSBP45954 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ACADSBP45954 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ACADSBP45954 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ACADSBP45954 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ACADSBP45954 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
ACADSBP45954 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ACADSBP45954 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ACADSBP45954 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ACADSBP45954 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ACADSBP45954 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
ACADSBP45954 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ACADSBP45954 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ACADSBP45954 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ACADSBP45954 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ACADSBP45954 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ACADSBP45954 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ACADSBP45954 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ACADSBP45954 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ACADSBP45954 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ACADSBP45954 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ACADSBP45954 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ACADSBP45954 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ACADSBP45954 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ACADSBP45954 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ACADSBP45954 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ACADSBP45954 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ACADSBP45954 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ACADSBP45954 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ACADSBP45954 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ACADSBP45954 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ACADSBP45954 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ACADSBP45954 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ACADSBP45954 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ACADSBP45954 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ACADSBP45954 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ACADSBP45954 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ACADSBP45954 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ACADSBP45954 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ACADSBP45954 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ACADSBP45954 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms