Protein–RNA interactions for Protein: P42166

TMPO, Lamina-associated polypeptide 2, isoform alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPOP42166 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TMPOP42166 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
TMPOP42166 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.99
TMPOP42166 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.99
TMPOP42166 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.99
TMPOP42166 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TMPOP42166 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TMPOP42166 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TMPOP42166 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TMPOP42166 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TMPOP42166 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TMPOP42166 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TMPOP42166 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TMPOP42166 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TMPOP42166 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TMPOP42166 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TMPOP42166 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TMPOP42166 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TMPOP42166 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
TMPOP42166 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
TMPOP42166 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TMPOP42166 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TMPOP42166 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TMPOP42166 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TMPOP42166 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TMPOP42166 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TMPOP42166 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TMPOP42166 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TMPOP42166 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TMPOP42166 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TMPOP42166 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
TMPOP42166 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TMPOP42166 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TMPOP42166 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TMPOP42166 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TMPOP42166 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TMPOP42166 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TMPOP42166 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TMPOP42166 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TMPOP42166 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TMPOP42166 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TMPOP42166 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TMPOP42166 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TMPOP42166 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TMPOP42166 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TMPOP42166 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TMPOP42166 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TMPOP42166 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TMPOP42166 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TMPOP42166 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TMPOP42166 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TMPOP42166 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TMPOP42166 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TMPOP42166 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TMPOP42166 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TMPOP42166 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
TMPOP42166 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TMPOP42166 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TMPOP42166 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TMPOP42166 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
TMPOP42166 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TMPOP42166 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TMPOP42166 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TMPOP42166 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TMPOP42166 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TMPOP42166 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TMPOP42166 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TMPOP42166 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TMPOP42166 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TMPOP42166 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TMPOP42166 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
TMPOP42166 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TMPOP42166 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TMPOP42166 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TMPOP42166 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TMPOP42166 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TMPOP42166 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TMPOP42166 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TMPOP42166 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TMPOP42166 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TMPOP42166 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TMPOP42166 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TMPOP42166 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TMPOP42166 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TMPOP42166 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TMPOP42166 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TMPOP42166 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TMPOP42166 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TMPOP42166 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TMPOP42166 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TMPOP42166 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TMPOP42166 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TMPOP42166 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TMPOP42166 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TMPOP42166 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TMPOP42166 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TMPOP42166 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TMPOP42166 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
TMPOP42166 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TMPOP42166 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms