Protein–RNA interactions for Protein: P35212

GJA4, Gap junction alpha-4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA4P35212 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GJA4P35212 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GJA4P35212 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GJA4P35212 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GJA4P35212 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GJA4P35212 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GJA4P35212 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GJA4P35212 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GJA4P35212 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GJA4P35212 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GJA4P35212 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GJA4P35212 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GJA4P35212 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GJA4P35212 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
GJA4P35212 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GJA4P35212 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GJA4P35212 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GJA4P35212 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GJA4P35212 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GJA4P35212 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GJA4P35212 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GJA4P35212 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GJA4P35212 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GJA4P35212 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GJA4P35212 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GJA4P35212 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GJA4P35212 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GJA4P35212 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GJA4P35212 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GJA4P35212 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GJA4P35212 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
GJA4P35212 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GJA4P35212 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GJA4P35212 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GJA4P35212 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GJA4P35212 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GJA4P35212 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
GJA4P35212 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GJA4P35212 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GJA4P35212 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GJA4P35212 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GJA4P35212 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GJA4P35212 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GJA4P35212 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GJA4P35212 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GJA4P35212 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GJA4P35212 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
GJA4P35212 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GJA4P35212 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GJA4P35212 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GJA4P35212 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
GJA4P35212 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GJA4P35212 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GJA4P35212 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
GJA4P35212 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GJA4P35212 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
GJA4P35212 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GJA4P35212 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GJA4P35212 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GJA4P35212 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GJA4P35212 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GJA4P35212 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GJA4P35212 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GJA4P35212 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GJA4P35212 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GJA4P35212 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GJA4P35212 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GJA4P35212 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GJA4P35212 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GJA4P35212 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GJA4P35212 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GJA4P35212 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GJA4P35212 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
GJA4P35212 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GJA4P35212 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GJA4P35212 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GJA4P35212 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GJA4P35212 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GJA4P35212 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GJA4P35212 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GJA4P35212 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GJA4P35212 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GJA4P35212 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GJA4P35212 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GJA4P35212 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GJA4P35212 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
GJA4P35212 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GJA4P35212 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GJA4P35212 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GJA4P35212 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
GJA4P35212 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GJA4P35212 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GJA4P35212 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GJA4P35212 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GJA4P35212 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GJA4P35212 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GJA4P35212 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
GJA4P35212 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
GJA4P35212 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GJA4P35212 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.6 ms