Protein–RNA interactions for Protein: P32418

SLC8A1, Sodium/calcium exchanger 1, humanhuman

Predictions only

Length 973 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC8A1P32418 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC8A1P32418 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC8A1P32418 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC8A1P32418 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC8A1P32418 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC8A1P32418 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC8A1P32418 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC8A1P32418 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC8A1P32418 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC8A1P32418 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC8A1P32418 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC8A1P32418 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC8A1P32418 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC8A1P32418 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC8A1P32418 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC8A1P32418 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC8A1P32418 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC8A1P32418 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC8A1P32418 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC8A1P32418 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC8A1P32418 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC8A1P32418 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC8A1P32418 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC8A1P32418 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC8A1P32418 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC8A1P32418 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC8A1P32418 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC8A1P32418 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC8A1P32418 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC8A1P32418 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC8A1P32418 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC8A1P32418 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC8A1P32418 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC8A1P32418 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC8A1P32418 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC8A1P32418 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC8A1P32418 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC8A1P32418 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC8A1P32418 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC8A1P32418 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC8A1P32418 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC8A1P32418 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC8A1P32418 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC8A1P32418 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC8A1P32418 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC8A1P32418 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC8A1P32418 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC8A1P32418 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC8A1P32418 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC8A1P32418 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC8A1P32418 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC8A1P32418 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC8A1P32418 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC8A1P32418 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC8A1P32418 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC8A1P32418 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC8A1P32418 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC8A1P32418 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC8A1P32418 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC8A1P32418 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC8A1P32418 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC8A1P32418 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC8A1P32418 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC8A1P32418 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC8A1P32418 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC8A1P32418 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC8A1P32418 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC8A1P32418 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC8A1P32418 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC8A1P32418 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC8A1P32418 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC8A1P32418 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC8A1P32418 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC8A1P32418 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC8A1P32418 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC8A1P32418 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC8A1P32418 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC8A1P32418 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC8A1P32418 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC8A1P32418 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC8A1P32418 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC8A1P32418 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC8A1P32418 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC8A1P32418 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC8A1P32418 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC8A1P32418 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC8A1P32418 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC8A1P32418 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC8A1P32418 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC8A1P32418 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC8A1P32418 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC8A1P32418 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC8A1P32418 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC8A1P32418 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC8A1P32418 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC8A1P32418 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC8A1P32418 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC8A1P32418 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC8A1P32418 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC8A1P32418 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms