Protein–RNA interactions for Protein: P25774

CTSS, Cathepsin S, humanhuman

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSSP25774 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CTSSP25774 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CTSSP25774 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CTSSP25774 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
CTSSP25774 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CTSSP25774 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CTSSP25774 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CTSSP25774 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CTSSP25774 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
CTSSP25774 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
CTSSP25774 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CTSSP25774 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CTSSP25774 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CTSSP25774 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CTSSP25774 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CTSSP25774 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CTSSP25774 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CTSSP25774 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CTSSP25774 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CTSSP25774 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CTSSP25774 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CTSSP25774 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CTSSP25774 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
CTSSP25774 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CTSSP25774 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CTSSP25774 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CTSSP25774 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CTSSP25774 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CTSSP25774 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CTSSP25774 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CTSSP25774 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CTSSP25774 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CTSSP25774 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CTSSP25774 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CTSSP25774 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
CTSSP25774 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CTSSP25774 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CTSSP25774 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CTSSP25774 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CTSSP25774 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CTSSP25774 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
CTSSP25774 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CTSSP25774 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
CTSSP25774 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CTSSP25774 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
CTSSP25774 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CTSSP25774 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CTSSP25774 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CTSSP25774 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
CTSSP25774 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CTSSP25774 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CTSSP25774 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CTSSP25774 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CTSSP25774 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CTSSP25774 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CTSSP25774 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CTSSP25774 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CTSSP25774 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CTSSP25774 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CTSSP25774 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CTSSP25774 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CTSSP25774 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CTSSP25774 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CTSSP25774 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CTSSP25774 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CTSSP25774 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CTSSP25774 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
CTSSP25774 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CTSSP25774 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CTSSP25774 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CTSSP25774 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CTSSP25774 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CTSSP25774 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CTSSP25774 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CTSSP25774 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
CTSSP25774 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
CTSSP25774 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
CTSSP25774 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CTSSP25774 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CTSSP25774 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CTSSP25774 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CTSSP25774 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CTSSP25774 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CTSSP25774 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
CTSSP25774 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CTSSP25774 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CTSSP25774 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CTSSP25774 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CTSSP25774 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CTSSP25774 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CTSSP25774 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CTSSP25774 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CTSSP25774 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CTSSP25774 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CTSSP25774 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CTSSP25774 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CTSSP25774 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CTSSP25774 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CTSSP25774 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CTSSP25774 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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