Protein–RNA interactions for Protein: P20700

LMNB1, Lamin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNB1P20700 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
LMNB1P20700 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
LMNB1P20700 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
LMNB1P20700 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
LMNB1P20700 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
LMNB1P20700 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
LMNB1P20700 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
LMNB1P20700 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
LMNB1P20700 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
LMNB1P20700 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
LMNB1P20700 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
LMNB1P20700 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
LMNB1P20700 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
LMNB1P20700 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
LMNB1P20700 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
LMNB1P20700 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
LMNB1P20700 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
LMNB1P20700 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
LMNB1P20700 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
LMNB1P20700 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
LMNB1P20700 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
LMNB1P20700 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
LMNB1P20700 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
LMNB1P20700 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
LMNB1P20700 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
LMNB1P20700 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
LMNB1P20700 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
LMNB1P20700 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
LMNB1P20700 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
LMNB1P20700 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
LMNB1P20700 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC19.59■□□□□ 0.73
LMNB1P20700 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
LMNB1P20700 LINC01278-203ENST00000608788 820 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
LMNB1P20700 LINC01278-207ENST00000610234 555 ntTSL 4 BASIC19.59■□□□□ 0.73
LMNB1P20700 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
LMNB1P20700 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
LMNB1P20700 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
LMNB1P20700 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
LMNB1P20700 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
LMNB1P20700 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
LMNB1P20700 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
LMNB1P20700 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
LMNB1P20700 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
LMNB1P20700 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
LMNB1P20700 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
LMNB1P20700 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
LMNB1P20700 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
LMNB1P20700 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
LMNB1P20700 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
LMNB1P20700 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
LMNB1P20700 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
LMNB1P20700 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
LMNB1P20700 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
LMNB1P20700 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
LMNB1P20700 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
LMNB1P20700 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
LMNB1P20700 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
LMNB1P20700 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
LMNB1P20700 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
LMNB1P20700 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
LMNB1P20700 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC19.58■□□□□ 0.72
LMNB1P20700 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.58■□□□□ 0.72
LMNB1P20700 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
LMNB1P20700 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
LMNB1P20700 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
LMNB1P20700 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
LMNB1P20700 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
LMNB1P20700 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
LMNB1P20700 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC19.58■□□□□ 0.72
LMNB1P20700 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
LMNB1P20700 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
LMNB1P20700 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
LMNB1P20700 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
LMNB1P20700 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
LMNB1P20700 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
LMNB1P20700 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
LMNB1P20700 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
LMNB1P20700 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
LMNB1P20700 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
LMNB1P20700 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
LMNB1P20700 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
LMNB1P20700 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
LMNB1P20700 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
LMNB1P20700 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
LMNB1P20700 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
LMNB1P20700 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
LMNB1P20700 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
LMNB1P20700 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
LMNB1P20700 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
LMNB1P20700 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
LMNB1P20700 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
LMNB1P20700 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
LMNB1P20700 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
LMNB1P20700 FXNP2-201ENST00000411625 547 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
LMNB1P20700 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
LMNB1P20700 LINC01806-201ENST00000436506 765 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
LMNB1P20700 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
LMNB1P20700 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
LMNB1P20700 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
LMNB1P20700 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms