Protein–RNA interactions for Protein: P18031

PTPN1, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN1P18031 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPN1P18031 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPN1P18031 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPN1P18031 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPN1P18031 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPN1P18031 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPN1P18031 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPN1P18031 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPN1P18031 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPN1P18031 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPN1P18031 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPN1P18031 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPN1P18031 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPN1P18031 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPN1P18031 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPN1P18031 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPN1P18031 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPN1P18031 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPN1P18031 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPN1P18031 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPN1P18031 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPN1P18031 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPN1P18031 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPN1P18031 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPN1P18031 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPN1P18031 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPN1P18031 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPN1P18031 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPN1P18031 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPN1P18031 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPN1P18031 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPN1P18031 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPN1P18031 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPN1P18031 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPN1P18031 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPN1P18031 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPN1P18031 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPN1P18031 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPN1P18031 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPN1P18031 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPN1P18031 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPN1P18031 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPN1P18031 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPN1P18031 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPN1P18031 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPN1P18031 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPN1P18031 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPN1P18031 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPN1P18031 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPN1P18031 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPN1P18031 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPN1P18031 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPN1P18031 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPN1P18031 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPN1P18031 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPN1P18031 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPN1P18031 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPN1P18031 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTPN1P18031 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTPN1P18031 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTPN1P18031 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTPN1P18031 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTPN1P18031 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTPN1P18031 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTPN1P18031 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTPN1P18031 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTPN1P18031 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTPN1P18031 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTPN1P18031 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTPN1P18031 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTPN1P18031 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTPN1P18031 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTPN1P18031 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTPN1P18031 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTPN1P18031 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTPN1P18031 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTPN1P18031 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
PTPN1P18031 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTPN1P18031 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTPN1P18031 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTPN1P18031 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTPN1P18031 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
PTPN1P18031 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTPN1P18031 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTPN1P18031 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTPN1P18031 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTPN1P18031 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
PTPN1P18031 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTPN1P18031 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTPN1P18031 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTPN1P18031 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTPN1P18031 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTPN1P18031 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTPN1P18031 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTPN1P18031 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTPN1P18031 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTPN1P18031 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTPN1P18031 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTPN1P18031 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTPN1P18031 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms