Protein–RNA interactions for Protein: P0CJ79

ZNF888, Zinc finger protein 888, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF888P0CJ79 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF888P0CJ79 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF888P0CJ79 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF888P0CJ79 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF888P0CJ79 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF888P0CJ79 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF888P0CJ79 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF888P0CJ79 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF888P0CJ79 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF888P0CJ79 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF888P0CJ79 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF888P0CJ79 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF888P0CJ79 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF888P0CJ79 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF888P0CJ79 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF888P0CJ79 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF888P0CJ79 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF888P0CJ79 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF888P0CJ79 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF888P0CJ79 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF888P0CJ79 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF888P0CJ79 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF888P0CJ79 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF888P0CJ79 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF888P0CJ79 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF888P0CJ79 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF888P0CJ79 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF888P0CJ79 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF888P0CJ79 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF888P0CJ79 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF888P0CJ79 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF888P0CJ79 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF888P0CJ79 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF888P0CJ79 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF888P0CJ79 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF888P0CJ79 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF888P0CJ79 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF888P0CJ79 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF888P0CJ79 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF888P0CJ79 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF888P0CJ79 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF888P0CJ79 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF888P0CJ79 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF888P0CJ79 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF888P0CJ79 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF888P0CJ79 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF888P0CJ79 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF888P0CJ79 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF888P0CJ79 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF888P0CJ79 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF888P0CJ79 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF888P0CJ79 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF888P0CJ79 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF888P0CJ79 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF888P0CJ79 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF888P0CJ79 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF888P0CJ79 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF888P0CJ79 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF888P0CJ79 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF888P0CJ79 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF888P0CJ79 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF888P0CJ79 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF888P0CJ79 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF888P0CJ79 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF888P0CJ79 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF888P0CJ79 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF888P0CJ79 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF888P0CJ79 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF888P0CJ79 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF888P0CJ79 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF888P0CJ79 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF888P0CJ79 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF888P0CJ79 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF888P0CJ79 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF888P0CJ79 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF888P0CJ79 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF888P0CJ79 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF888P0CJ79 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF888P0CJ79 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF888P0CJ79 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF888P0CJ79 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF888P0CJ79 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF888P0CJ79 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF888P0CJ79 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF888P0CJ79 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF888P0CJ79 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF888P0CJ79 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF888P0CJ79 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF888P0CJ79 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF888P0CJ79 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF888P0CJ79 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF888P0CJ79 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF888P0CJ79 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF888P0CJ79 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF888P0CJ79 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF888P0CJ79 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF888P0CJ79 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF888P0CJ79 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF888P0CJ79 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF888P0CJ79 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms