Protein–RNA interactions for Protein: P08575

PTPRC, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, humanhuman

Predictions only

Length 1,304 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCP08575 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
PTPRCP08575 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
PTPRCP08575 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC20.52■□□□□ 0.87
PTPRCP08575 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.87
PTPRCP08575 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
PTPRCP08575 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
PTPRCP08575 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPRCP08575 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPRCP08575 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPRCP08575 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPRCP08575 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPRCP08575 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPRCP08575 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPRCP08575 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPRCP08575 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPRCP08575 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPRCP08575 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPRCP08575 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPRCP08575 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPRCP08575 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPRCP08575 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPRCP08575 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPRCP08575 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPRCP08575 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPRCP08575 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPRCP08575 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPRCP08575 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPRCP08575 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPRCP08575 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPRCP08575 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPRCP08575 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPRCP08575 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPRCP08575 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPRCP08575 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPRCP08575 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPRCP08575 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPRCP08575 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPRCP08575 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPRCP08575 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPRCP08575 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPRCP08575 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPRCP08575 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPRCP08575 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPRCP08575 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPRCP08575 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPRCP08575 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPRCP08575 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPRCP08575 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPRCP08575 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPRCP08575 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPRCP08575 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPRCP08575 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPRCP08575 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPRCP08575 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPRCP08575 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPRCP08575 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPRCP08575 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPRCP08575 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPRCP08575 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPRCP08575 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPRCP08575 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPRCP08575 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPRCP08575 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPRCP08575 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPRCP08575 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPRCP08575 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPRCP08575 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPRCP08575 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPRCP08575 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPRCP08575 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPRCP08575 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPRCP08575 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPRCP08575 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPRCP08575 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPRCP08575 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPRCP08575 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPRCP08575 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPRCP08575 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPRCP08575 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPRCP08575 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPRCP08575 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPRCP08575 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPRCP08575 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPRCP08575 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPRCP08575 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPRCP08575 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPRCP08575 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPRCP08575 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPRCP08575 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPRCP08575 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPRCP08575 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPRCP08575 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPRCP08575 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPRCP08575 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTPRCP08575 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTPRCP08575 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTPRCP08575 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTPRCP08575 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTPRCP08575 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTPRCP08575 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
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