Protein–RNA interactions for Protein: P04141

CSF2, Granulocyte-macrophage colony-stimulating factor, humanhuman

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSF2P04141 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CSF2P04141 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CSF2P04141 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CSF2P04141 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSF2P04141 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSF2P04141 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSF2P04141 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSF2P04141 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CSF2P04141 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSF2P04141 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSF2P04141 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CSF2P04141 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSF2P04141 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSF2P04141 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSF2P04141 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSF2P04141 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CSF2P04141 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSF2P04141 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSF2P04141 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CSF2P04141 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CSF2P04141 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSF2P04141 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CSF2P04141 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSF2P04141 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSF2P04141 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSF2P04141 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSF2P04141 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSF2P04141 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSF2P04141 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSF2P04141 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSF2P04141 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSF2P04141 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSF2P04141 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSF2P04141 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSF2P04141 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSF2P04141 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSF2P04141 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSF2P04141 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSF2P04141 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSF2P04141 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSF2P04141 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSF2P04141 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSF2P04141 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSF2P04141 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSF2P04141 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSF2P04141 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSF2P04141 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSF2P04141 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSF2P04141 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSF2P04141 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSF2P04141 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSF2P04141 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSF2P04141 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSF2P04141 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSF2P04141 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSF2P04141 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSF2P04141 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSF2P04141 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSF2P04141 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSF2P04141 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSF2P04141 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSF2P04141 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSF2P04141 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSF2P04141 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSF2P04141 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSF2P04141 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSF2P04141 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CSF2P04141 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSF2P04141 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CSF2P04141 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSF2P04141 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CSF2P04141 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSF2P04141 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSF2P04141 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CSF2P04141 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSF2P04141 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSF2P04141 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CSF2P04141 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSF2P04141 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSF2P04141 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSF2P04141 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSF2P04141 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSF2P04141 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CSF2P04141 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSF2P04141 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CSF2P04141 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CSF2P04141 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CSF2P04141 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CSF2P04141 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CSF2P04141 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CSF2P04141 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CSF2P04141 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CSF2P04141 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CSF2P04141 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CSF2P04141 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CSF2P04141 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CSF2P04141 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CSF2P04141 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CSF2P04141 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CSF2P04141 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms