Protein–RNA interactions for Protein: O95219

SNX4, Sorting nexin-4, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX4O95219 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX4O95219 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX4O95219 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX4O95219 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX4O95219 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX4O95219 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX4O95219 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX4O95219 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX4O95219 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX4O95219 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX4O95219 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX4O95219 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX4O95219 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX4O95219 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX4O95219 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX4O95219 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX4O95219 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX4O95219 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX4O95219 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX4O95219 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX4O95219 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX4O95219 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX4O95219 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX4O95219 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX4O95219 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX4O95219 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX4O95219 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX4O95219 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX4O95219 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX4O95219 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX4O95219 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX4O95219 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX4O95219 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX4O95219 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX4O95219 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX4O95219 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX4O95219 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX4O95219 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX4O95219 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX4O95219 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX4O95219 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX4O95219 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX4O95219 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX4O95219 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX4O95219 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX4O95219 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX4O95219 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX4O95219 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX4O95219 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX4O95219 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX4O95219 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX4O95219 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX4O95219 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX4O95219 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX4O95219 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX4O95219 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX4O95219 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX4O95219 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX4O95219 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX4O95219 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX4O95219 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX4O95219 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX4O95219 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX4O95219 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX4O95219 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNX4O95219 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNX4O95219 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNX4O95219 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNX4O95219 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNX4O95219 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNX4O95219 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNX4O95219 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNX4O95219 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNX4O95219 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNX4O95219 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNX4O95219 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNX4O95219 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNX4O95219 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNX4O95219 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNX4O95219 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNX4O95219 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNX4O95219 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNX4O95219 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNX4O95219 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNX4O95219 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNX4O95219 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNX4O95219 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SNX4O95219 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNX4O95219 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNX4O95219 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNX4O95219 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNX4O95219 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SNX4O95219 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNX4O95219 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNX4O95219 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNX4O95219 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNX4O95219 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNX4O95219 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNX4O95219 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SNX4O95219 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms