Protein–RNA interactions for Protein: O75648

TRMU, Mitochondrial tRNA-specific 2-thiouridylase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 421 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRMUO75648 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRMUO75648 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRMUO75648 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRMUO75648 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRMUO75648 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRMUO75648 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRMUO75648 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRMUO75648 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRMUO75648 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TRMUO75648 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRMUO75648 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRMUO75648 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRMUO75648 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRMUO75648 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRMUO75648 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRMUO75648 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRMUO75648 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRMUO75648 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRMUO75648 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRMUO75648 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRMUO75648 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRMUO75648 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRMUO75648 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRMUO75648 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRMUO75648 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRMUO75648 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRMUO75648 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRMUO75648 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRMUO75648 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRMUO75648 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRMUO75648 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRMUO75648 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRMUO75648 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRMUO75648 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRMUO75648 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRMUO75648 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRMUO75648 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRMUO75648 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRMUO75648 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRMUO75648 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRMUO75648 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRMUO75648 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRMUO75648 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRMUO75648 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRMUO75648 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRMUO75648 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRMUO75648 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRMUO75648 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TRMUO75648 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRMUO75648 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRMUO75648 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRMUO75648 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRMUO75648 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRMUO75648 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRMUO75648 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRMUO75648 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRMUO75648 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRMUO75648 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRMUO75648 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TRMUO75648 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TRMUO75648 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRMUO75648 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRMUO75648 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRMUO75648 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRMUO75648 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRMUO75648 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRMUO75648 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRMUO75648 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TRMUO75648 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRMUO75648 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRMUO75648 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRMUO75648 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRMUO75648 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRMUO75648 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRMUO75648 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRMUO75648 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRMUO75648 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRMUO75648 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRMUO75648 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRMUO75648 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRMUO75648 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRMUO75648 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRMUO75648 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRMUO75648 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRMUO75648 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRMUO75648 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRMUO75648 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRMUO75648 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRMUO75648 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRMUO75648 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRMUO75648 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRMUO75648 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRMUO75648 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRMUO75648 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRMUO75648 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRMUO75648 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRMUO75648 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRMUO75648 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRMUO75648 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRMUO75648 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms