Protein–RNA interactions for Protein: O75145

PPFIA3, Liprin-alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA3O75145 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PPFIA3O75145 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PPFIA3O75145 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PPFIA3O75145 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PPFIA3O75145 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PPFIA3O75145 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PPFIA3O75145 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PPFIA3O75145 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PPFIA3O75145 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PPFIA3O75145 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PPFIA3O75145 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
PPFIA3O75145 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PPFIA3O75145 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
PPFIA3O75145 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PPFIA3O75145 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PPFIA3O75145 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PPFIA3O75145 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PPFIA3O75145 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PPFIA3O75145 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
PPFIA3O75145 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PPFIA3O75145 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PPFIA3O75145 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PPFIA3O75145 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PPFIA3O75145 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PPFIA3O75145 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PPFIA3O75145 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PPFIA3O75145 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PPFIA3O75145 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PPFIA3O75145 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PPFIA3O75145 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PPFIA3O75145 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PPFIA3O75145 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PPFIA3O75145 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PPFIA3O75145 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PPFIA3O75145 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PPFIA3O75145 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PPFIA3O75145 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PPFIA3O75145 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PPFIA3O75145 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PPFIA3O75145 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PPFIA3O75145 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PPFIA3O75145 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PPFIA3O75145 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PPFIA3O75145 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PPFIA3O75145 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PPFIA3O75145 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PPFIA3O75145 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PPFIA3O75145 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PPFIA3O75145 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PPFIA3O75145 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PPFIA3O75145 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PPFIA3O75145 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PPFIA3O75145 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PPFIA3O75145 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PPFIA3O75145 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PPFIA3O75145 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PPFIA3O75145 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PPFIA3O75145 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PPFIA3O75145 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
PPFIA3O75145 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PPFIA3O75145 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PPFIA3O75145 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PPFIA3O75145 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PPFIA3O75145 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PPFIA3O75145 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PPFIA3O75145 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PPFIA3O75145 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PPFIA3O75145 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PPFIA3O75145 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PPFIA3O75145 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PPFIA3O75145 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PPFIA3O75145 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PPFIA3O75145 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PPFIA3O75145 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PPFIA3O75145 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PPFIA3O75145 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PPFIA3O75145 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PPFIA3O75145 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PPFIA3O75145 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PPFIA3O75145 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PPFIA3O75145 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PPFIA3O75145 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PPFIA3O75145 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PPFIA3O75145 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PPFIA3O75145 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PPFIA3O75145 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
PPFIA3O75145 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
PPFIA3O75145 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PPFIA3O75145 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
PPFIA3O75145 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PPFIA3O75145 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PPFIA3O75145 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PPFIA3O75145 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
PPFIA3O75145 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PPFIA3O75145 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PPFIA3O75145 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PPFIA3O75145 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PPFIA3O75145 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PPFIA3O75145 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PPFIA3O75145 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms