Protein–RNA interactions for Protein: O60759

CYTIP, Cytohesin-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTIPO60759 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CYTIPO60759 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CYTIPO60759 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CYTIPO60759 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CYTIPO60759 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CYTIPO60759 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CYTIPO60759 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CYTIPO60759 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CYTIPO60759 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CYTIPO60759 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CYTIPO60759 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CYTIPO60759 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CYTIPO60759 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CYTIPO60759 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CYTIPO60759 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CYTIPO60759 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CYTIPO60759 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CYTIPO60759 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CYTIPO60759 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CYTIPO60759 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CYTIPO60759 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CYTIPO60759 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CYTIPO60759 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CYTIPO60759 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CYTIPO60759 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CYTIPO60759 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CYTIPO60759 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CYTIPO60759 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CYTIPO60759 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CYTIPO60759 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CYTIPO60759 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CYTIPO60759 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CYTIPO60759 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CYTIPO60759 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CYTIPO60759 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CYTIPO60759 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CYTIPO60759 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CYTIPO60759 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CYTIPO60759 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CYTIPO60759 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CYTIPO60759 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CYTIPO60759 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CYTIPO60759 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CYTIPO60759 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CYTIPO60759 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CYTIPO60759 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CYTIPO60759 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CYTIPO60759 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CYTIPO60759 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
CYTIPO60759 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
CYTIPO60759 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
CYTIPO60759 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
CYTIPO60759 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CYTIPO60759 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CYTIPO60759 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CYTIPO60759 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CYTIPO60759 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CYTIPO60759 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CYTIPO60759 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CYTIPO60759 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CYTIPO60759 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CYTIPO60759 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CYTIPO60759 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
CYTIPO60759 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
CYTIPO60759 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CYTIPO60759 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CYTIPO60759 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CYTIPO60759 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CYTIPO60759 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CYTIPO60759 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CYTIPO60759 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CYTIPO60759 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
CYTIPO60759 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CYTIPO60759 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CYTIPO60759 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CYTIPO60759 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
CYTIPO60759 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
CYTIPO60759 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CYTIPO60759 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CYTIPO60759 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
CYTIPO60759 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CYTIPO60759 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CYTIPO60759 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CYTIPO60759 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CYTIPO60759 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
CYTIPO60759 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CYTIPO60759 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CYTIPO60759 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CYTIPO60759 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CYTIPO60759 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CYTIPO60759 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CYTIPO60759 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CYTIPO60759 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CYTIPO60759 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CYTIPO60759 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CYTIPO60759 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CYTIPO60759 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CYTIPO60759 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CYTIPO60759 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CYTIPO60759 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 133 ms