Protein–RNA interactions for Protein: E9PCH4

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,651 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E9PCH4 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
E9PCH4 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
E9PCH4 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
E9PCH4 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
E9PCH4 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
E9PCH4 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
E9PCH4 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
E9PCH4 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
E9PCH4 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
E9PCH4 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
E9PCH4 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
E9PCH4 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
E9PCH4 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
E9PCH4 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
E9PCH4 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
E9PCH4 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
E9PCH4 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
E9PCH4 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
E9PCH4 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
E9PCH4 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
E9PCH4 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
E9PCH4 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
E9PCH4 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
E9PCH4 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
E9PCH4 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
E9PCH4 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
E9PCH4 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
E9PCH4 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
E9PCH4 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
E9PCH4 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
E9PCH4 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
E9PCH4 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
E9PCH4 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
E9PCH4 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
E9PCH4 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
E9PCH4 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
E9PCH4 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
E9PCH4 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
E9PCH4 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
E9PCH4 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
E9PCH4 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
E9PCH4 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
E9PCH4 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
E9PCH4 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
E9PCH4 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
E9PCH4 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
E9PCH4 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
E9PCH4 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
E9PCH4 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
E9PCH4 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
E9PCH4 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
E9PCH4 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
E9PCH4 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
E9PCH4 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
E9PCH4 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
E9PCH4 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
E9PCH4 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
E9PCH4 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
E9PCH4 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
E9PCH4 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
E9PCH4 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
E9PCH4 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
E9PCH4 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
E9PCH4 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
E9PCH4 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
E9PCH4 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
E9PCH4 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
E9PCH4 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
E9PCH4 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
E9PCH4 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
E9PCH4 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
E9PCH4 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
E9PCH4 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
E9PCH4 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
E9PCH4 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
E9PCH4 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
E9PCH4 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
E9PCH4 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
E9PCH4 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
E9PCH4 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
E9PCH4 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
E9PCH4 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
E9PCH4 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
E9PCH4 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
E9PCH4 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
E9PCH4 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
E9PCH4 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
E9PCH4 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
E9PCH4 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
E9PCH4 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
E9PCH4 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
E9PCH4 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
E9PCH4 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
E9PCH4 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
E9PCH4 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
E9PCH4 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
E9PCH4 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
E9PCH4 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
E9PCH4 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
E9PCH4 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms