Protein–RNA interactions for Protein: E9PBE3

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E9PBE3 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
E9PBE3 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
E9PBE3 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
E9PBE3 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
E9PBE3 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
E9PBE3 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
E9PBE3 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
E9PBE3 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
E9PBE3 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
E9PBE3 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
E9PBE3 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
E9PBE3 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
E9PBE3 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
E9PBE3 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
E9PBE3 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
E9PBE3 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
E9PBE3 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
E9PBE3 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
E9PBE3 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
E9PBE3 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
E9PBE3 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
E9PBE3 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
E9PBE3 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
E9PBE3 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
E9PBE3 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
E9PBE3 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
E9PBE3 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
E9PBE3 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
E9PBE3 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
E9PBE3 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
E9PBE3 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
E9PBE3 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
E9PBE3 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
E9PBE3 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
E9PBE3 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
E9PBE3 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
E9PBE3 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
E9PBE3 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
E9PBE3 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
E9PBE3 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
E9PBE3 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
E9PBE3 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
E9PBE3 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
E9PBE3 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
E9PBE3 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
E9PBE3 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
E9PBE3 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
E9PBE3 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
E9PBE3 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
E9PBE3 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
E9PBE3 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
E9PBE3 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
E9PBE3 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
E9PBE3 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
E9PBE3 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
E9PBE3 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
E9PBE3 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
E9PBE3 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
E9PBE3 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
E9PBE3 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
E9PBE3 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
E9PBE3 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
E9PBE3 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
E9PBE3 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
E9PBE3 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
E9PBE3 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
E9PBE3 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
E9PBE3 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
E9PBE3 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
E9PBE3 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
E9PBE3 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
E9PBE3 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
E9PBE3 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
E9PBE3 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
E9PBE3 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
E9PBE3 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
E9PBE3 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
E9PBE3 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
E9PBE3 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
E9PBE3 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
E9PBE3 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
E9PBE3 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC16■□□□□ 0.15
E9PBE3 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
E9PBE3 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
E9PBE3 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
E9PBE3 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
E9PBE3 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
E9PBE3 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
E9PBE3 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
E9PBE3 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
E9PBE3 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
E9PBE3 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
E9PBE3 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
E9PBE3 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
E9PBE3 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
E9PBE3 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
E9PBE3 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
E9PBE3 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
E9PBE3 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
E9PBE3 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms