Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJD0

RIMS3, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIMS3Q9UJD0 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RIMS3Q9UJD0 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RIMS3Q9UJD0 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RIMS3Q9UJD0 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RIMS3Q9UJD0 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RIMS3Q9UJD0 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RIMS3Q9UJD0 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RIMS3Q9UJD0 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RIMS3Q9UJD0 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RIMS3Q9UJD0 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RIMS3Q9UJD0 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RIMS3Q9UJD0 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
RIMS3Q9UJD0 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RIMS3Q9UJD0 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RIMS3Q9UJD0 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RIMS3Q9UJD0 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RIMS3Q9UJD0 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RIMS3Q9UJD0 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
RIMS3Q9UJD0 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RIMS3Q9UJD0 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RIMS3Q9UJD0 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
RIMS3Q9UJD0 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RIMS3Q9UJD0 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RIMS3Q9UJD0 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RIMS3Q9UJD0 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RIMS3Q9UJD0 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RIMS3Q9UJD0 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
RIMS3Q9UJD0 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RIMS3Q9UJD0 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
RIMS3Q9UJD0 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RIMS3Q9UJD0 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RIMS3Q9UJD0 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RIMS3Q9UJD0 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RIMS3Q9UJD0 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RIMS3Q9UJD0 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RIMS3Q9UJD0 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RIMS3Q9UJD0 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RIMS3Q9UJD0 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RIMS3Q9UJD0 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RIMS3Q9UJD0 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RIMS3Q9UJD0 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RIMS3Q9UJD0 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RIMS3Q9UJD0 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RIMS3Q9UJD0 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RIMS3Q9UJD0 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RIMS3Q9UJD0 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RIMS3Q9UJD0 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RIMS3Q9UJD0 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RIMS3Q9UJD0 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RIMS3Q9UJD0 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RIMS3Q9UJD0 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RIMS3Q9UJD0 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RIMS3Q9UJD0 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RIMS3Q9UJD0 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RIMS3Q9UJD0 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RIMS3Q9UJD0 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RIMS3Q9UJD0 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RIMS3Q9UJD0 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RIMS3Q9UJD0 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RIMS3Q9UJD0 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RIMS3Q9UJD0 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RIMS3Q9UJD0 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RIMS3Q9UJD0 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RIMS3Q9UJD0 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RIMS3Q9UJD0 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RIMS3Q9UJD0 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RIMS3Q9UJD0 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RIMS3Q9UJD0 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RIMS3Q9UJD0 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RIMS3Q9UJD0 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RIMS3Q9UJD0 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RIMS3Q9UJD0 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RIMS3Q9UJD0 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RIMS3Q9UJD0 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RIMS3Q9UJD0 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RIMS3Q9UJD0 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RIMS3Q9UJD0 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RIMS3Q9UJD0 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RIMS3Q9UJD0 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RIMS3Q9UJD0 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RIMS3Q9UJD0 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RIMS3Q9UJD0 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RIMS3Q9UJD0 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RIMS3Q9UJD0 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RIMS3Q9UJD0 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RIMS3Q9UJD0 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RIMS3Q9UJD0 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RIMS3Q9UJD0 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RIMS3Q9UJD0 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RIMS3Q9UJD0 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RIMS3Q9UJD0 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RIMS3Q9UJD0 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RIMS3Q9UJD0 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RIMS3Q9UJD0 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RIMS3Q9UJD0 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RIMS3Q9UJD0 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RIMS3Q9UJD0 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RIMS3Q9UJD0 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RIMS3Q9UJD0 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RIMS3Q9UJD0 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.5 ms