Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIW2

PLXNA1, Plexin-A1, humanhuman

Predictions only

Length 1,896 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXNA1Q9UIW2 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PLXNA1Q9UIW2 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PLXNA1Q9UIW2 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PLXNA1Q9UIW2 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PLXNA1Q9UIW2 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PLXNA1Q9UIW2 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
PLXNA1Q9UIW2 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PLXNA1Q9UIW2 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
PLXNA1Q9UIW2 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PLXNA1Q9UIW2 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PLXNA1Q9UIW2 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PLXNA1Q9UIW2 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PLXNA1Q9UIW2 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PLXNA1Q9UIW2 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PLXNA1Q9UIW2 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PLXNA1Q9UIW2 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PLXNA1Q9UIW2 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PLXNA1Q9UIW2 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PLXNA1Q9UIW2 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PLXNA1Q9UIW2 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PLXNA1Q9UIW2 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PLXNA1Q9UIW2 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PLXNA1Q9UIW2 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PLXNA1Q9UIW2 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PLXNA1Q9UIW2 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PLXNA1Q9UIW2 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PLXNA1Q9UIW2 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PLXNA1Q9UIW2 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PLXNA1Q9UIW2 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PLXNA1Q9UIW2 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PLXNA1Q9UIW2 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PLXNA1Q9UIW2 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PLXNA1Q9UIW2 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PLXNA1Q9UIW2 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PLXNA1Q9UIW2 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PLXNA1Q9UIW2 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PLXNA1Q9UIW2 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PLXNA1Q9UIW2 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PLXNA1Q9UIW2 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PLXNA1Q9UIW2 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PLXNA1Q9UIW2 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PLXNA1Q9UIW2 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PLXNA1Q9UIW2 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PLXNA1Q9UIW2 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PLXNA1Q9UIW2 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PLXNA1Q9UIW2 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PLXNA1Q9UIW2 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PLXNA1Q9UIW2 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PLXNA1Q9UIW2 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PLXNA1Q9UIW2 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PLXNA1Q9UIW2 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PLXNA1Q9UIW2 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PLXNA1Q9UIW2 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PLXNA1Q9UIW2 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PLXNA1Q9UIW2 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PLXNA1Q9UIW2 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PLXNA1Q9UIW2 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PLXNA1Q9UIW2 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PLXNA1Q9UIW2 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PLXNA1Q9UIW2 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PLXNA1Q9UIW2 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PLXNA1Q9UIW2 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PLXNA1Q9UIW2 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PLXNA1Q9UIW2 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PLXNA1Q9UIW2 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PLXNA1Q9UIW2 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PLXNA1Q9UIW2 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PLXNA1Q9UIW2 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PLXNA1Q9UIW2 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PLXNA1Q9UIW2 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PLXNA1Q9UIW2 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PLXNA1Q9UIW2 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PLXNA1Q9UIW2 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PLXNA1Q9UIW2 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PLXNA1Q9UIW2 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PLXNA1Q9UIW2 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PLXNA1Q9UIW2 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PLXNA1Q9UIW2 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PLXNA1Q9UIW2 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PLXNA1Q9UIW2 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PLXNA1Q9UIW2 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PLXNA1Q9UIW2 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PLXNA1Q9UIW2 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PLXNA1Q9UIW2 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PLXNA1Q9UIW2 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PLXNA1Q9UIW2 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PLXNA1Q9UIW2 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PLXNA1Q9UIW2 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PLXNA1Q9UIW2 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PLXNA1Q9UIW2 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PLXNA1Q9UIW2 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PLXNA1Q9UIW2 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PLXNA1Q9UIW2 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PLXNA1Q9UIW2 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PLXNA1Q9UIW2 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PLXNA1Q9UIW2 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PLXNA1Q9UIW2 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PLXNA1Q9UIW2 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PLXNA1Q9UIW2 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PLXNA1Q9UIW2 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58 ms