Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0J7

KCMF1, E3 ubiquitin-protein ligase KCMF1, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCMF1Q9P0J7 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KCMF1Q9P0J7 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KCMF1Q9P0J7 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KCMF1Q9P0J7 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
KCMF1Q9P0J7 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KCMF1Q9P0J7 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
KCMF1Q9P0J7 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KCMF1Q9P0J7 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KCMF1Q9P0J7 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KCMF1Q9P0J7 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KCMF1Q9P0J7 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KCMF1Q9P0J7 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KCMF1Q9P0J7 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KCMF1Q9P0J7 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KCMF1Q9P0J7 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KCMF1Q9P0J7 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KCMF1Q9P0J7 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KCMF1Q9P0J7 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KCMF1Q9P0J7 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KCMF1Q9P0J7 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KCMF1Q9P0J7 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KCMF1Q9P0J7 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KCMF1Q9P0J7 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KCMF1Q9P0J7 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KCMF1Q9P0J7 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KCMF1Q9P0J7 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KCMF1Q9P0J7 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KCMF1Q9P0J7 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KCMF1Q9P0J7 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KCMF1Q9P0J7 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KCMF1Q9P0J7 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KCMF1Q9P0J7 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KCMF1Q9P0J7 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KCMF1Q9P0J7 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
KCMF1Q9P0J7 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KCMF1Q9P0J7 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KCMF1Q9P0J7 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KCMF1Q9P0J7 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KCMF1Q9P0J7 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KCMF1Q9P0J7 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KCMF1Q9P0J7 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
KCMF1Q9P0J7 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
KCMF1Q9P0J7 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KCMF1Q9P0J7 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KCMF1Q9P0J7 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KCMF1Q9P0J7 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KCMF1Q9P0J7 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KCMF1Q9P0J7 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KCMF1Q9P0J7 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
KCMF1Q9P0J7 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
KCMF1Q9P0J7 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KCMF1Q9P0J7 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KCMF1Q9P0J7 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KCMF1Q9P0J7 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KCMF1Q9P0J7 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KCMF1Q9P0J7 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KCMF1Q9P0J7 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KCMF1Q9P0J7 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KCMF1Q9P0J7 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KCMF1Q9P0J7 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KCMF1Q9P0J7 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KCMF1Q9P0J7 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KCMF1Q9P0J7 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KCMF1Q9P0J7 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KCMF1Q9P0J7 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KCMF1Q9P0J7 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KCMF1Q9P0J7 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KCMF1Q9P0J7 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KCMF1Q9P0J7 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KCMF1Q9P0J7 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KCMF1Q9P0J7 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KCMF1Q9P0J7 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
KCMF1Q9P0J7 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KCMF1Q9P0J7 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KCMF1Q9P0J7 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KCMF1Q9P0J7 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KCMF1Q9P0J7 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KCMF1Q9P0J7 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KCMF1Q9P0J7 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
KCMF1Q9P0J7 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KCMF1Q9P0J7 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KCMF1Q9P0J7 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KCMF1Q9P0J7 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
KCMF1Q9P0J7 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KCMF1Q9P0J7 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KCMF1Q9P0J7 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KCMF1Q9P0J7 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KCMF1Q9P0J7 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KCMF1Q9P0J7 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KCMF1Q9P0J7 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KCMF1Q9P0J7 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KCMF1Q9P0J7 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KCMF1Q9P0J7 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KCMF1Q9P0J7 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KCMF1Q9P0J7 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KCMF1Q9P0J7 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KCMF1Q9P0J7 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KCMF1Q9P0J7 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
KCMF1Q9P0J7 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
KCMF1Q9P0J7 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.1 ms