Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVR7

TBCCD1, TBCC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 557 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBCCD1Q9NVR7 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TBCCD1Q9NVR7 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TBCCD1Q9NVR7 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TBCCD1Q9NVR7 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TBCCD1Q9NVR7 TRIM17-203ENST00000366697 2652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TBCCD1Q9NVR7 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TBCCD1Q9NVR7 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TBCCD1Q9NVR7 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TBCCD1Q9NVR7 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TBCCD1Q9NVR7 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TBCCD1Q9NVR7 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TBCCD1Q9NVR7 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TBCCD1Q9NVR7 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TBCCD1Q9NVR7 LINC00987-201ENST00000427111 2472 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TBCCD1Q9NVR7 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TBCCD1Q9NVR7 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TBCCD1Q9NVR7 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TBCCD1Q9NVR7 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TBCCD1Q9NVR7 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TBCCD1Q9NVR7 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TBCCD1Q9NVR7 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TBCCD1Q9NVR7 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TBCCD1Q9NVR7 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TBCCD1Q9NVR7 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TBCCD1Q9NVR7 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TBCCD1Q9NVR7 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
TBCCD1Q9NVR7 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TBCCD1Q9NVR7 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TBCCD1Q9NVR7 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
TBCCD1Q9NVR7 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TBCCD1Q9NVR7 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TBCCD1Q9NVR7 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
TBCCD1Q9NVR7 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
TBCCD1Q9NVR7 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TBCCD1Q9NVR7 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
TBCCD1Q9NVR7 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TBCCD1Q9NVR7 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TBCCD1Q9NVR7 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TBCCD1Q9NVR7 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TBCCD1Q9NVR7 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TBCCD1Q9NVR7 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TBCCD1Q9NVR7 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TBCCD1Q9NVR7 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
TBCCD1Q9NVR7 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TBCCD1Q9NVR7 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TBCCD1Q9NVR7 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TBCCD1Q9NVR7 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TBCCD1Q9NVR7 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TBCCD1Q9NVR7 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TBCCD1Q9NVR7 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TBCCD1Q9NVR7 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TBCCD1Q9NVR7 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TBCCD1Q9NVR7 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TBCCD1Q9NVR7 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TBCCD1Q9NVR7 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TBCCD1Q9NVR7 AC079447.1-201ENST00000424491 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TBCCD1Q9NVR7 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
TBCCD1Q9NVR7 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TBCCD1Q9NVR7 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TBCCD1Q9NVR7 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TBCCD1Q9NVR7 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TBCCD1Q9NVR7 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TBCCD1Q9NVR7 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TBCCD1Q9NVR7 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TBCCD1Q9NVR7 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TBCCD1Q9NVR7 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TBCCD1Q9NVR7 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TBCCD1Q9NVR7 LONP1-202ENST00000540670 3002 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TBCCD1Q9NVR7 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TBCCD1Q9NVR7 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TBCCD1Q9NVR7 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TBCCD1Q9NVR7 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TBCCD1Q9NVR7 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TBCCD1Q9NVR7 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TBCCD1Q9NVR7 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TBCCD1Q9NVR7 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TBCCD1Q9NVR7 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TBCCD1Q9NVR7 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
TBCCD1Q9NVR7 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
TBCCD1Q9NVR7 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TBCCD1Q9NVR7 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TBCCD1Q9NVR7 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TBCCD1Q9NVR7 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TBCCD1Q9NVR7 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TBCCD1Q9NVR7 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
TBCCD1Q9NVR7 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TBCCD1Q9NVR7 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TBCCD1Q9NVR7 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TBCCD1Q9NVR7 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TBCCD1Q9NVR7 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TBCCD1Q9NVR7 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TBCCD1Q9NVR7 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TBCCD1Q9NVR7 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TBCCD1Q9NVR7 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TBCCD1Q9NVR7 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TBCCD1Q9NVR7 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TBCCD1Q9NVR7 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TBCCD1Q9NVR7 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TBCCD1Q9NVR7 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TBCCD1Q9NVR7 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
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