Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQP4

PFDN4, Prefoldin subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFDN4Q9NQP4 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PFDN4Q9NQP4 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PFDN4Q9NQP4 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PFDN4Q9NQP4 WWC2-201ENST00000403733 8826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PFDN4Q9NQP4 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PFDN4Q9NQP4 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PFDN4Q9NQP4 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PFDN4Q9NQP4 GRSF1-201ENST00000254799 6666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PFDN4Q9NQP4 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PFDN4Q9NQP4 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PFDN4Q9NQP4 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PFDN4Q9NQP4 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PFDN4Q9NQP4 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PFDN4Q9NQP4 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PFDN4Q9NQP4 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PFDN4Q9NQP4 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PFDN4Q9NQP4 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PFDN4Q9NQP4 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PFDN4Q9NQP4 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PFDN4Q9NQP4 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PFDN4Q9NQP4 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PFDN4Q9NQP4 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PFDN4Q9NQP4 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
PFDN4Q9NQP4 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PFDN4Q9NQP4 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PFDN4Q9NQP4 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PFDN4Q9NQP4 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
PFDN4Q9NQP4 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PFDN4Q9NQP4 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PFDN4Q9NQP4 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PFDN4Q9NQP4 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PFDN4Q9NQP4 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PFDN4Q9NQP4 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PFDN4Q9NQP4 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PFDN4Q9NQP4 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PFDN4Q9NQP4 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PFDN4Q9NQP4 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PFDN4Q9NQP4 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PFDN4Q9NQP4 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PFDN4Q9NQP4 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PFDN4Q9NQP4 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PFDN4Q9NQP4 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
PFDN4Q9NQP4 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PFDN4Q9NQP4 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PFDN4Q9NQP4 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PFDN4Q9NQP4 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PFDN4Q9NQP4 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PFDN4Q9NQP4 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PFDN4Q9NQP4 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PFDN4Q9NQP4 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PFDN4Q9NQP4 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PFDN4Q9NQP4 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PFDN4Q9NQP4 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PFDN4Q9NQP4 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PFDN4Q9NQP4 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PFDN4Q9NQP4 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PFDN4Q9NQP4 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PFDN4Q9NQP4 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PFDN4Q9NQP4 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PFDN4Q9NQP4 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PFDN4Q9NQP4 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PFDN4Q9NQP4 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PFDN4Q9NQP4 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PFDN4Q9NQP4 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PFDN4Q9NQP4 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PFDN4Q9NQP4 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PFDN4Q9NQP4 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PFDN4Q9NQP4 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PFDN4Q9NQP4 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PFDN4Q9NQP4 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PFDN4Q9NQP4 STEAP2-202ENST00000394621 7033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PFDN4Q9NQP4 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PFDN4Q9NQP4 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PFDN4Q9NQP4 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PFDN4Q9NQP4 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PFDN4Q9NQP4 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PFDN4Q9NQP4 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PFDN4Q9NQP4 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PFDN4Q9NQP4 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PFDN4Q9NQP4 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PFDN4Q9NQP4 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PFDN4Q9NQP4 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PFDN4Q9NQP4 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PFDN4Q9NQP4 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PFDN4Q9NQP4 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PFDN4Q9NQP4 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PFDN4Q9NQP4 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PFDN4Q9NQP4 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PFDN4Q9NQP4 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PFDN4Q9NQP4 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PFDN4Q9NQP4 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PFDN4Q9NQP4 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PFDN4Q9NQP4 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PFDN4Q9NQP4 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PFDN4Q9NQP4 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PFDN4Q9NQP4 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PFDN4Q9NQP4 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PFDN4Q9NQP4 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PFDN4Q9NQP4 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PFDN4Q9NQP4 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms