Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP64

ZCCHC17, Nucleolar protein of 40 kDa, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC17Q9NP64 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZCCHC17Q9NP64 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZCCHC17Q9NP64 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZCCHC17Q9NP64 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZCCHC17Q9NP64 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZCCHC17Q9NP64 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZCCHC17Q9NP64 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
ZCCHC17Q9NP64 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
ZCCHC17Q9NP64 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
ZCCHC17Q9NP64 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
ZCCHC17Q9NP64 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ZCCHC17Q9NP64 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
ZCCHC17Q9NP64 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
ZCCHC17Q9NP64 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ZCCHC17Q9NP64 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
ZCCHC17Q9NP64 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
ZCCHC17Q9NP64 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
ZCCHC17Q9NP64 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ZCCHC17Q9NP64 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ZCCHC17Q9NP64 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ZCCHC17Q9NP64 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ZCCHC17Q9NP64 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ZCCHC17Q9NP64 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ZCCHC17Q9NP64 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ZCCHC17Q9NP64 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ZCCHC17Q9NP64 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ZCCHC17Q9NP64 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ZCCHC17Q9NP64 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ZCCHC17Q9NP64 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ZCCHC17Q9NP64 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ZCCHC17Q9NP64 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ZCCHC17Q9NP64 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
ZCCHC17Q9NP64 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ZCCHC17Q9NP64 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ZCCHC17Q9NP64 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ZCCHC17Q9NP64 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ZCCHC17Q9NP64 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ZCCHC17Q9NP64 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ZCCHC17Q9NP64 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ZCCHC17Q9NP64 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ZCCHC17Q9NP64 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ZCCHC17Q9NP64 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ZCCHC17Q9NP64 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
ZCCHC17Q9NP64 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ZCCHC17Q9NP64 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ZCCHC17Q9NP64 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ZCCHC17Q9NP64 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ZCCHC17Q9NP64 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ZCCHC17Q9NP64 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ZCCHC17Q9NP64 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ZCCHC17Q9NP64 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZCCHC17Q9NP64 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZCCHC17Q9NP64 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZCCHC17Q9NP64 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZCCHC17Q9NP64 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZCCHC17Q9NP64 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZCCHC17Q9NP64 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZCCHC17Q9NP64 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZCCHC17Q9NP64 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZCCHC17Q9NP64 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZCCHC17Q9NP64 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZCCHC17Q9NP64 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZCCHC17Q9NP64 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZCCHC17Q9NP64 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
ZCCHC17Q9NP64 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZCCHC17Q9NP64 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZCCHC17Q9NP64 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZCCHC17Q9NP64 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZCCHC17Q9NP64 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZCCHC17Q9NP64 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZCCHC17Q9NP64 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZCCHC17Q9NP64 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZCCHC17Q9NP64 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZCCHC17Q9NP64 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZCCHC17Q9NP64 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZCCHC17Q9NP64 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZCCHC17Q9NP64 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZCCHC17Q9NP64 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZCCHC17Q9NP64 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZCCHC17Q9NP64 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZCCHC17Q9NP64 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZCCHC17Q9NP64 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZCCHC17Q9NP64 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZCCHC17Q9NP64 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZCCHC17Q9NP64 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
ZCCHC17Q9NP64 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZCCHC17Q9NP64 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZCCHC17Q9NP64 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZCCHC17Q9NP64 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ZCCHC17Q9NP64 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ZCCHC17Q9NP64 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ZCCHC17Q9NP64 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ZCCHC17Q9NP64 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ZCCHC17Q9NP64 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ZCCHC17Q9NP64 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ZCCHC17Q9NP64 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ZCCHC17Q9NP64 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ZCCHC17Q9NP64 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ZCCHC17Q9NP64 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ZCCHC17Q9NP64 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms