Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZN0

GPR88, Probable G-protein coupled receptor 88, humanhuman

Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPR88Q9GZN0 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GPR88Q9GZN0 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GPR88Q9GZN0 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GPR88Q9GZN0 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GPR88Q9GZN0 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GPR88Q9GZN0 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GPR88Q9GZN0 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GPR88Q9GZN0 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GPR88Q9GZN0 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
GPR88Q9GZN0 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GPR88Q9GZN0 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GPR88Q9GZN0 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GPR88Q9GZN0 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GPR88Q9GZN0 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GPR88Q9GZN0 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GPR88Q9GZN0 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
GPR88Q9GZN0 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GPR88Q9GZN0 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GPR88Q9GZN0 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GPR88Q9GZN0 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GPR88Q9GZN0 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GPR88Q9GZN0 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GPR88Q9GZN0 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GPR88Q9GZN0 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GPR88Q9GZN0 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GPR88Q9GZN0 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
GPR88Q9GZN0 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GPR88Q9GZN0 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GPR88Q9GZN0 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GPR88Q9GZN0 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GPR88Q9GZN0 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GPR88Q9GZN0 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
GPR88Q9GZN0 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
GPR88Q9GZN0 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
GPR88Q9GZN0 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
GPR88Q9GZN0 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
GPR88Q9GZN0 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
GPR88Q9GZN0 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
GPR88Q9GZN0 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GPR88Q9GZN0 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GPR88Q9GZN0 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GPR88Q9GZN0 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GPR88Q9GZN0 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GPR88Q9GZN0 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GPR88Q9GZN0 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GPR88Q9GZN0 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GPR88Q9GZN0 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
GPR88Q9GZN0 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GPR88Q9GZN0 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GPR88Q9GZN0 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
GPR88Q9GZN0 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GPR88Q9GZN0 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
GPR88Q9GZN0 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
GPR88Q9GZN0 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GPR88Q9GZN0 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GPR88Q9GZN0 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GPR88Q9GZN0 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GPR88Q9GZN0 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GPR88Q9GZN0 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GPR88Q9GZN0 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GPR88Q9GZN0 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GPR88Q9GZN0 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GPR88Q9GZN0 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GPR88Q9GZN0 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GPR88Q9GZN0 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GPR88Q9GZN0 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GPR88Q9GZN0 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GPR88Q9GZN0 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GPR88Q9GZN0 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GPR88Q9GZN0 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GPR88Q9GZN0 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GPR88Q9GZN0 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GPR88Q9GZN0 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GPR88Q9GZN0 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GPR88Q9GZN0 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GPR88Q9GZN0 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GPR88Q9GZN0 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GPR88Q9GZN0 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GPR88Q9GZN0 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GPR88Q9GZN0 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GPR88Q9GZN0 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
GPR88Q9GZN0 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GPR88Q9GZN0 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GPR88Q9GZN0 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GPR88Q9GZN0 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GPR88Q9GZN0 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GPR88Q9GZN0 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GPR88Q9GZN0 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GPR88Q9GZN0 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
GPR88Q9GZN0 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GPR88Q9GZN0 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GPR88Q9GZN0 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GPR88Q9GZN0 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GPR88Q9GZN0 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
GPR88Q9GZN0 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GPR88Q9GZN0 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
GPR88Q9GZN0 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GPR88Q9GZN0 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GPR88Q9GZN0 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GPR88Q9GZN0 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63 ms