Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0F1

CEP44, Centrosomal protein of 44 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP44Q9C0F1 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CEP44Q9C0F1 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CEP44Q9C0F1 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CEP44Q9C0F1 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CEP44Q9C0F1 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CEP44Q9C0F1 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CEP44Q9C0F1 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CEP44Q9C0F1 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CEP44Q9C0F1 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CEP44Q9C0F1 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CEP44Q9C0F1 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CEP44Q9C0F1 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CEP44Q9C0F1 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CEP44Q9C0F1 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CEP44Q9C0F1 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CEP44Q9C0F1 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CEP44Q9C0F1 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CEP44Q9C0F1 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CEP44Q9C0F1 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CEP44Q9C0F1 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CEP44Q9C0F1 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CEP44Q9C0F1 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CEP44Q9C0F1 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CEP44Q9C0F1 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CEP44Q9C0F1 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CEP44Q9C0F1 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CEP44Q9C0F1 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CEP44Q9C0F1 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CEP44Q9C0F1 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CEP44Q9C0F1 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CEP44Q9C0F1 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CEP44Q9C0F1 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CEP44Q9C0F1 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CEP44Q9C0F1 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CEP44Q9C0F1 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CEP44Q9C0F1 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CEP44Q9C0F1 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CEP44Q9C0F1 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CEP44Q9C0F1 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CEP44Q9C0F1 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CEP44Q9C0F1 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CEP44Q9C0F1 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CEP44Q9C0F1 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CEP44Q9C0F1 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CEP44Q9C0F1 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CEP44Q9C0F1 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CEP44Q9C0F1 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CEP44Q9C0F1 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CEP44Q9C0F1 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CEP44Q9C0F1 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CEP44Q9C0F1 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CEP44Q9C0F1 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CEP44Q9C0F1 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CEP44Q9C0F1 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CEP44Q9C0F1 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CEP44Q9C0F1 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CEP44Q9C0F1 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CEP44Q9C0F1 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CEP44Q9C0F1 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CEP44Q9C0F1 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CEP44Q9C0F1 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CEP44Q9C0F1 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CEP44Q9C0F1 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CEP44Q9C0F1 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CEP44Q9C0F1 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CEP44Q9C0F1 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CEP44Q9C0F1 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CEP44Q9C0F1 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CEP44Q9C0F1 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CEP44Q9C0F1 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CEP44Q9C0F1 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CEP44Q9C0F1 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CEP44Q9C0F1 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CEP44Q9C0F1 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CEP44Q9C0F1 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CEP44Q9C0F1 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CEP44Q9C0F1 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CEP44Q9C0F1 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CEP44Q9C0F1 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CEP44Q9C0F1 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CEP44Q9C0F1 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CEP44Q9C0F1 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CEP44Q9C0F1 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CEP44Q9C0F1 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CEP44Q9C0F1 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CEP44Q9C0F1 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CEP44Q9C0F1 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CEP44Q9C0F1 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CEP44Q9C0F1 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CEP44Q9C0F1 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CEP44Q9C0F1 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CEP44Q9C0F1 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CEP44Q9C0F1 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CEP44Q9C0F1 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CEP44Q9C0F1 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CEP44Q9C0F1 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CEP44Q9C0F1 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CEP44Q9C0F1 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CEP44Q9C0F1 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CEP44Q9C0F1 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms