Protein–RNA interactions for Protein: Q9C000

NLRP1, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP1Q9C000 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NLRP1Q9C000 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NLRP1Q9C000 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NLRP1Q9C000 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NLRP1Q9C000 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NLRP1Q9C000 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NLRP1Q9C000 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NLRP1Q9C000 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NLRP1Q9C000 FXNP2-201ENST00000411625 547 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
NLRP1Q9C000 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
NLRP1Q9C000 DGUOK-AS1-202ENST00000439192 563 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NLRP1Q9C000 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
NLRP1Q9C000 AC074194.1-201ENST00000505025 622 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NLRP1Q9C000 AC100858.3-202ENST00000533496 553 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NLRP1Q9C000 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NLRP1Q9C000 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NLRP1Q9C000 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
NLRP1Q9C000 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
NLRP1Q9C000 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NLRP1Q9C000 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
NLRP1Q9C000 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NLRP1Q9C000 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
NLRP1Q9C000 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NLRP1Q9C000 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NLRP1Q9C000 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NLRP1Q9C000 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NLRP1Q9C000 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NLRP1Q9C000 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NLRP1Q9C000 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NLRP1Q9C000 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NLRP1Q9C000 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NLRP1Q9C000 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NLRP1Q9C000 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NLRP1Q9C000 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NLRP1Q9C000 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NLRP1Q9C000 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NLRP1Q9C000 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NLRP1Q9C000 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NLRP1Q9C000 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NLRP1Q9C000 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NLRP1Q9C000 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NLRP1Q9C000 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NLRP1Q9C000 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NLRP1Q9C000 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NLRP1Q9C000 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NLRP1Q9C000 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
NLRP1Q9C000 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NLRP1Q9C000 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
NLRP1Q9C000 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NLRP1Q9C000 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NLRP1Q9C000 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NLRP1Q9C000 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NLRP1Q9C000 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NLRP1Q9C000 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NLRP1Q9C000 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NLRP1Q9C000 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NLRP1Q9C000 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NLRP1Q9C000 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NLRP1Q9C000 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NLRP1Q9C000 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NLRP1Q9C000 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NLRP1Q9C000 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NLRP1Q9C000 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NLRP1Q9C000 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
NLRP1Q9C000 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NLRP1Q9C000 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NLRP1Q9C000 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NLRP1Q9C000 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NLRP1Q9C000 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NLRP1Q9C000 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NLRP1Q9C000 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NLRP1Q9C000 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NLRP1Q9C000 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.27
NLRP1Q9C000 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
NLRP1Q9C000 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NLRP1Q9C000 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NLRP1Q9C000 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NLRP1Q9C000 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NLRP1Q9C000 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NLRP1Q9C000 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NLRP1Q9C000 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NLRP1Q9C000 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NLRP1Q9C000 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NLRP1Q9C000 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NLRP1Q9C000 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NLRP1Q9C000 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NLRP1Q9C000 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NLRP1Q9C000 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NLRP1Q9C000 NKX3-1-202ENST00000523261 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NLRP1Q9C000 AC079328.1-201ENST00000560358 952 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
NLRP1Q9C000 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
NLRP1Q9C000 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NLRP1Q9C000 AC016629.1-201ENST00000596579 586 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
NLRP1Q9C000 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NLRP1Q9C000 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
NLRP1Q9C000 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NLRP1Q9C000 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NLRP1Q9C000 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NLRP1Q9C000 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NLRP1Q9C000 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms