Protein–RNA interactions for Protein: Q9BPY8

HOPX, Homeodomain-only protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 73 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOPXQ9BPY8 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
HOPXQ9BPY8 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOPXQ9BPY8 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOPXQ9BPY8 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOPXQ9BPY8 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOPXQ9BPY8 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOPXQ9BPY8 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOPXQ9BPY8 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOPXQ9BPY8 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOPXQ9BPY8 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOPXQ9BPY8 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOPXQ9BPY8 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOPXQ9BPY8 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOPXQ9BPY8 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOPXQ9BPY8 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOPXQ9BPY8 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOPXQ9BPY8 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
HOPXQ9BPY8 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOPXQ9BPY8 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOPXQ9BPY8 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOPXQ9BPY8 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOPXQ9BPY8 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOPXQ9BPY8 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOPXQ9BPY8 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOPXQ9BPY8 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
HOPXQ9BPY8 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
HOPXQ9BPY8 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOPXQ9BPY8 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOPXQ9BPY8 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
HOPXQ9BPY8 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOPXQ9BPY8 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOPXQ9BPY8 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOPXQ9BPY8 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOPXQ9BPY8 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOPXQ9BPY8 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOPXQ9BPY8 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOPXQ9BPY8 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOPXQ9BPY8 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOPXQ9BPY8 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOPXQ9BPY8 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOPXQ9BPY8 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOPXQ9BPY8 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOPXQ9BPY8 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOPXQ9BPY8 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOPXQ9BPY8 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOPXQ9BPY8 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOPXQ9BPY8 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOPXQ9BPY8 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOPXQ9BPY8 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOPXQ9BPY8 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOPXQ9BPY8 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOPXQ9BPY8 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOPXQ9BPY8 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOPXQ9BPY8 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOPXQ9BPY8 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOPXQ9BPY8 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOPXQ9BPY8 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
HOPXQ9BPY8 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOPXQ9BPY8 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOPXQ9BPY8 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOPXQ9BPY8 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOPXQ9BPY8 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOPXQ9BPY8 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOPXQ9BPY8 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOPXQ9BPY8 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
HOPXQ9BPY8 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
HOPXQ9BPY8 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
HOPXQ9BPY8 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOPXQ9BPY8 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOPXQ9BPY8 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOPXQ9BPY8 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOPXQ9BPY8 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOPXQ9BPY8 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOPXQ9BPY8 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOPXQ9BPY8 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOPXQ9BPY8 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOPXQ9BPY8 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOPXQ9BPY8 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOPXQ9BPY8 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
HOPXQ9BPY8 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOPXQ9BPY8 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOPXQ9BPY8 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOPXQ9BPY8 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOPXQ9BPY8 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOPXQ9BPY8 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOPXQ9BPY8 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOPXQ9BPY8 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOPXQ9BPY8 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOPXQ9BPY8 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOPXQ9BPY8 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOPXQ9BPY8 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOPXQ9BPY8 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOPXQ9BPY8 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOPXQ9BPY8 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOPXQ9BPY8 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOPXQ9BPY8 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOPXQ9BPY8 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOPXQ9BPY8 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOPXQ9BPY8 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOPXQ9BPY8 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms