Protein–RNA interactions for Protein: Q9BPW4

APOL4, Apolipoprotein L4, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOL4Q9BPW4 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
APOL4Q9BPW4 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
APOL4Q9BPW4 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
APOL4Q9BPW4 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
APOL4Q9BPW4 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
APOL4Q9BPW4 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
APOL4Q9BPW4 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
APOL4Q9BPW4 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
APOL4Q9BPW4 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
APOL4Q9BPW4 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
APOL4Q9BPW4 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
APOL4Q9BPW4 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
APOL4Q9BPW4 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
APOL4Q9BPW4 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
APOL4Q9BPW4 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
APOL4Q9BPW4 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
APOL4Q9BPW4 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
APOL4Q9BPW4 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
APOL4Q9BPW4 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
APOL4Q9BPW4 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
APOL4Q9BPW4 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
APOL4Q9BPW4 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
APOL4Q9BPW4 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
APOL4Q9BPW4 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
APOL4Q9BPW4 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
APOL4Q9BPW4 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
APOL4Q9BPW4 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
APOL4Q9BPW4 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
APOL4Q9BPW4 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
APOL4Q9BPW4 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
APOL4Q9BPW4 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
APOL4Q9BPW4 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
APOL4Q9BPW4 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
APOL4Q9BPW4 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
APOL4Q9BPW4 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
APOL4Q9BPW4 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
APOL4Q9BPW4 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
APOL4Q9BPW4 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
APOL4Q9BPW4 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
APOL4Q9BPW4 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
APOL4Q9BPW4 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
APOL4Q9BPW4 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
APOL4Q9BPW4 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
APOL4Q9BPW4 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
APOL4Q9BPW4 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
APOL4Q9BPW4 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
APOL4Q9BPW4 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
APOL4Q9BPW4 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
APOL4Q9BPW4 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
APOL4Q9BPW4 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
APOL4Q9BPW4 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
APOL4Q9BPW4 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
APOL4Q9BPW4 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
APOL4Q9BPW4 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
APOL4Q9BPW4 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
APOL4Q9BPW4 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
APOL4Q9BPW4 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
APOL4Q9BPW4 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
APOL4Q9BPW4 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
APOL4Q9BPW4 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
APOL4Q9BPW4 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
APOL4Q9BPW4 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
APOL4Q9BPW4 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
APOL4Q9BPW4 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
APOL4Q9BPW4 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
APOL4Q9BPW4 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
APOL4Q9BPW4 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
APOL4Q9BPW4 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
APOL4Q9BPW4 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
APOL4Q9BPW4 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
APOL4Q9BPW4 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
APOL4Q9BPW4 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
APOL4Q9BPW4 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
APOL4Q9BPW4 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
APOL4Q9BPW4 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
APOL4Q9BPW4 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
APOL4Q9BPW4 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
APOL4Q9BPW4 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
APOL4Q9BPW4 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
APOL4Q9BPW4 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
APOL4Q9BPW4 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
APOL4Q9BPW4 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
APOL4Q9BPW4 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
APOL4Q9BPW4 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
APOL4Q9BPW4 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
APOL4Q9BPW4 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
APOL4Q9BPW4 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
APOL4Q9BPW4 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
APOL4Q9BPW4 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
APOL4Q9BPW4 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
APOL4Q9BPW4 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
APOL4Q9BPW4 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
APOL4Q9BPW4 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
APOL4Q9BPW4 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
APOL4Q9BPW4 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
APOL4Q9BPW4 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
APOL4Q9BPW4 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
APOL4Q9BPW4 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
APOL4Q9BPW4 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
APOL4Q9BPW4 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms