Protein–RNA interactions for Protein: Q99985

SEMA3C, Semaphorin-3C, humanhuman

Predictions only

Length 751 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3CQ99985 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SEMA3CQ99985 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SEMA3CQ99985 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SEMA3CQ99985 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SEMA3CQ99985 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SEMA3CQ99985 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SEMA3CQ99985 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SEMA3CQ99985 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SEMA3CQ99985 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SEMA3CQ99985 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SEMA3CQ99985 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SEMA3CQ99985 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SEMA3CQ99985 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SEMA3CQ99985 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SEMA3CQ99985 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SEMA3CQ99985 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SEMA3CQ99985 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SEMA3CQ99985 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SEMA3CQ99985 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SEMA3CQ99985 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SEMA3CQ99985 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SEMA3CQ99985 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SEMA3CQ99985 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SEMA3CQ99985 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SEMA3CQ99985 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SEMA3CQ99985 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SEMA3CQ99985 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SEMA3CQ99985 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SEMA3CQ99985 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SEMA3CQ99985 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SEMA3CQ99985 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SEMA3CQ99985 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SEMA3CQ99985 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SEMA3CQ99985 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SEMA3CQ99985 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SEMA3CQ99985 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SEMA3CQ99985 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SEMA3CQ99985 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SEMA3CQ99985 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SEMA3CQ99985 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SEMA3CQ99985 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SEMA3CQ99985 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SEMA3CQ99985 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SEMA3CQ99985 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SEMA3CQ99985 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SEMA3CQ99985 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SEMA3CQ99985 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SEMA3CQ99985 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SEMA3CQ99985 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SEMA3CQ99985 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SEMA3CQ99985 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SEMA3CQ99985 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SEMA3CQ99985 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SEMA3CQ99985 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SEMA3CQ99985 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SEMA3CQ99985 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SEMA3CQ99985 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SEMA3CQ99985 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SEMA3CQ99985 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SEMA3CQ99985 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SEMA3CQ99985 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SEMA3CQ99985 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SEMA3CQ99985 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SEMA3CQ99985 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SEMA3CQ99985 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SEMA3CQ99985 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SEMA3CQ99985 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SEMA3CQ99985 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SEMA3CQ99985 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SEMA3CQ99985 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SEMA3CQ99985 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SEMA3CQ99985 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SEMA3CQ99985 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SEMA3CQ99985 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SEMA3CQ99985 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SEMA3CQ99985 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SEMA3CQ99985 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SEMA3CQ99985 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SEMA3CQ99985 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SEMA3CQ99985 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SEMA3CQ99985 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SEMA3CQ99985 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SEMA3CQ99985 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SEMA3CQ99985 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SEMA3CQ99985 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SEMA3CQ99985 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SEMA3CQ99985 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SEMA3CQ99985 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SEMA3CQ99985 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SEMA3CQ99985 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SEMA3CQ99985 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SEMA3CQ99985 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SEMA3CQ99985 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SEMA3CQ99985 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SEMA3CQ99985 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SEMA3CQ99985 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SEMA3CQ99985 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SEMA3CQ99985 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SEMA3CQ99985 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SEMA3CQ99985 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms