Protein–RNA interactions for Protein: Q96PV0

SYNGAP1, Ras/Rap GTPase-activating protein SynGAP, humanhuman

Predictions only

Length 1,343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGAP1Q96PV0 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SYNGAP1Q96PV0 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SYNGAP1Q96PV0 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SYNGAP1Q96PV0 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SYNGAP1Q96PV0 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SYNGAP1Q96PV0 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SYNGAP1Q96PV0 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SYNGAP1Q96PV0 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SYNGAP1Q96PV0 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SYNGAP1Q96PV0 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SYNGAP1Q96PV0 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SYNGAP1Q96PV0 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SYNGAP1Q96PV0 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SYNGAP1Q96PV0 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SYNGAP1Q96PV0 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SYNGAP1Q96PV0 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SYNGAP1Q96PV0 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SYNGAP1Q96PV0 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SYNGAP1Q96PV0 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SYNGAP1Q96PV0 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SYNGAP1Q96PV0 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SYNGAP1Q96PV0 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SYNGAP1Q96PV0 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SYNGAP1Q96PV0 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SYNGAP1Q96PV0 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SYNGAP1Q96PV0 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SYNGAP1Q96PV0 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SYNGAP1Q96PV0 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SYNGAP1Q96PV0 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SYNGAP1Q96PV0 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SYNGAP1Q96PV0 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SYNGAP1Q96PV0 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SYNGAP1Q96PV0 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SYNGAP1Q96PV0 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SYNGAP1Q96PV0 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SYNGAP1Q96PV0 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SYNGAP1Q96PV0 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SYNGAP1Q96PV0 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SYNGAP1Q96PV0 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SYNGAP1Q96PV0 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SYNGAP1Q96PV0 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SYNGAP1Q96PV0 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SYNGAP1Q96PV0 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SYNGAP1Q96PV0 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SYNGAP1Q96PV0 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SYNGAP1Q96PV0 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SYNGAP1Q96PV0 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SYNGAP1Q96PV0 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SYNGAP1Q96PV0 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SYNGAP1Q96PV0 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SYNGAP1Q96PV0 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SYNGAP1Q96PV0 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SYNGAP1Q96PV0 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SYNGAP1Q96PV0 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SYNGAP1Q96PV0 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SYNGAP1Q96PV0 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SYNGAP1Q96PV0 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SYNGAP1Q96PV0 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SYNGAP1Q96PV0 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SYNGAP1Q96PV0 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SYNGAP1Q96PV0 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SYNGAP1Q96PV0 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SYNGAP1Q96PV0 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SYNGAP1Q96PV0 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SYNGAP1Q96PV0 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SYNGAP1Q96PV0 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SYNGAP1Q96PV0 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SYNGAP1Q96PV0 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SYNGAP1Q96PV0 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SYNGAP1Q96PV0 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SYNGAP1Q96PV0 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SYNGAP1Q96PV0 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SYNGAP1Q96PV0 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SYNGAP1Q96PV0 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SYNGAP1Q96PV0 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SYNGAP1Q96PV0 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SYNGAP1Q96PV0 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SYNGAP1Q96PV0 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SYNGAP1Q96PV0 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SYNGAP1Q96PV0 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SYNGAP1Q96PV0 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SYNGAP1Q96PV0 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SYNGAP1Q96PV0 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SYNGAP1Q96PV0 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SYNGAP1Q96PV0 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SYNGAP1Q96PV0 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SYNGAP1Q96PV0 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SYNGAP1Q96PV0 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SYNGAP1Q96PV0 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SYNGAP1Q96PV0 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SYNGAP1Q96PV0 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SYNGAP1Q96PV0 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SYNGAP1Q96PV0 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SYNGAP1Q96PV0 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SYNGAP1Q96PV0 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SYNGAP1Q96PV0 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SYNGAP1Q96PV0 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SYNGAP1Q96PV0 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SYNGAP1Q96PV0 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SYNGAP1Q96PV0 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms