Protein–RNA interactions for Protein: Q96P20

NLRP3, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,036 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP3Q96P20 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NLRP3Q96P20 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NLRP3Q96P20 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NLRP3Q96P20 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NLRP3Q96P20 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
NLRP3Q96P20 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NLRP3Q96P20 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
NLRP3Q96P20 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
NLRP3Q96P20 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
NLRP3Q96P20 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
NLRP3Q96P20 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
NLRP3Q96P20 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
NLRP3Q96P20 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NLRP3Q96P20 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NLRP3Q96P20 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NLRP3Q96P20 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NLRP3Q96P20 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NLRP3Q96P20 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NLRP3Q96P20 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NLRP3Q96P20 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NLRP3Q96P20 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NLRP3Q96P20 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NLRP3Q96P20 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
NLRP3Q96P20 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NLRP3Q96P20 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NLRP3Q96P20 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NLRP3Q96P20 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NLRP3Q96P20 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NLRP3Q96P20 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NLRP3Q96P20 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NLRP3Q96P20 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NLRP3Q96P20 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NLRP3Q96P20 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NLRP3Q96P20 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NLRP3Q96P20 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NLRP3Q96P20 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NLRP3Q96P20 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NLRP3Q96P20 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NLRP3Q96P20 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NLRP3Q96P20 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
NLRP3Q96P20 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NLRP3Q96P20 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NLRP3Q96P20 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
NLRP3Q96P20 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NLRP3Q96P20 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NLRP3Q96P20 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
NLRP3Q96P20 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC20■□□□□ 0.79
NLRP3Q96P20 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NLRP3Q96P20 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
NLRP3Q96P20 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
NLRP3Q96P20 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC20■□□□□ 0.79
NLRP3Q96P20 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
NLRP3Q96P20 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
NLRP3Q96P20 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NLRP3Q96P20 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NLRP3Q96P20 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NLRP3Q96P20 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
NLRP3Q96P20 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NLRP3Q96P20 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NLRP3Q96P20 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NLRP3Q96P20 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NLRP3Q96P20 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NLRP3Q96P20 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NLRP3Q96P20 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NLRP3Q96P20 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NLRP3Q96P20 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NLRP3Q96P20 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NLRP3Q96P20 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NLRP3Q96P20 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NLRP3Q96P20 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NLRP3Q96P20 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NLRP3Q96P20 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NLRP3Q96P20 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NLRP3Q96P20 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NLRP3Q96P20 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NLRP3Q96P20 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NLRP3Q96P20 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NLRP3Q96P20 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NLRP3Q96P20 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
NLRP3Q96P20 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NLRP3Q96P20 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
NLRP3Q96P20 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NLRP3Q96P20 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NLRP3Q96P20 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NLRP3Q96P20 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NLRP3Q96P20 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NLRP3Q96P20 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NLRP3Q96P20 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
NLRP3Q96P20 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
NLRP3Q96P20 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NLRP3Q96P20 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NLRP3Q96P20 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NLRP3Q96P20 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NLRP3Q96P20 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NLRP3Q96P20 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NLRP3Q96P20 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NLRP3Q96P20 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NLRP3Q96P20 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NLRP3Q96P20 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NLRP3Q96P20 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms